iMetaOmics | 中国农大顾少华和左元梅组-开发线虫群落分析软件包

背景：土壤线虫作为土壤健康和生态功能的重要生物指示物，其群落分析对评估土壤生态系统至关重要，但现有工具在数据处理、计算复杂性和可视化方面存在局限。研究目的：为解决上述问题，本研究开发了R软件包easynem，旨在提供一个用户友好、集成化的分析平台，简化土壤线虫生态指数的计算和可视化流程，促进土壤健康研究。结论：easynem成功整合了数据读取、预处理、指数计算和可视化功能，并通过猕猴桃果园覆盖作物实验案例验证了其有效性，表明该软件包能够将线虫数据转化为有意义的生态学见解，为土壤健康评估提供标准化工具。