Nat Chem Biol | 邻近标记到底多邻近？陈知行/邹鹏合作用DNA尺子测量揭示新机制

背景：邻近标记技术广泛应用于空间组学和生物大分子相互作用研究，但其核心参数——作用半径——长期未能定量测定，影响数据解读和工具优化。研究目的：北京大学陈知行和邹鹏课题组合作，旨在构建基于DNA纳米结构的空间编码纳米尺平台，以纳米精度定量测量邻近标记酶的作用半径和机制。结论：研究发现APEX2同时存在接触标记和短程扩散两种机制，而TurboID的标记高度依赖酶与靶标的直接物理接触，而非中间体自由扩散。该研究首次直接量化了邻近标记的空间作用范围，为实验数据解读提供了机制依据，并展示了DNA纳米尺在纳米级生化反应分析中的潜力。