Nature | 6人2年追踪，揭秘肠道噬菌体：跨科感染+发现新类噬菌体

背景：肠道噬菌体对微生物生态和人类健康影响深远，但其动态变化、宿主范围和进化机制因技术限制尚不明确。传统短读长测序存在组装碎片化等缺陷，而长读长测序为解析噬菌体-宿主关系提供了新可能。研究目的：本研究利用长读长宏基因组测序技术，追踪6名健康成年人两年间的肠道样本，旨在深入探究原噬菌体与宿主细菌的动态相互作用，揭示噬菌体的生物学特性。结论：研究发现绝大多数原噬菌体在宿主中稳定整合，仅少数呈现动态变化；原噬菌体诱导多为低水平，大规模裂解罕见；部分噬菌体具有跨科感染的广谱宿主范围，打破了宿主特异性强的传统认知；此外，鉴定出一类新型IScream噬菌体，其利用驯化的细菌IS30转座酶进行整合，代表了噬菌体驯化细菌遗传元件的罕见案例，并通过实验证实了其可形成有感染活性的病毒颗粒。该研究为噬菌体研究提供了新范式，完善了噬菌体生物学理论。