Adv Sci综述 | 张超团队总结转录组学中的人工智能革命——从单细胞到空间图谱

本文综述了人工智能在单细胞和空间转录组数据分析中的最新进展。背景方面，单细胞和空间转录组技术能揭示细胞尺度的组织结构与功能，但其数据存在高维、稀疏或分辨率限制等分析挑战。研究目的上，文章系统梳理了现有人工智能方法，将其分为任务特定模型、基础模型和AI智能体三类，并按典型数据处理流程讨论了它们在去噪、聚类、注释等任务中的优势、局限及互补关系。结论指出，任务特定模型可解释性强但泛化有限；基础模型表征能力强却计算成本高；AI智能体能自动化工作流但依赖大语言模型性能。未来这些方法将趋于融合，构建“虚拟实验室”以更智能地推动生物发现。