阅读 Nature | 金属水解酶的计算设计

背景：金属水解酶在环境污染物降解等领域应用前景广阔，但现有从头设计方法常因活性中心构建受限而导致酶活性较低。研究目的：为突破传统设计限制，研究团队开发了RFdiffusion2生成模型，旨在实现无需预设序列位置和主链坐标、直接基于量子化学过渡态构型进行高活性金属水解酶的从头设计。结论：通过结合RFdiffusion2与PLACER筛选策略，成功设计出催化效率接近定向进化水平的新型锌金属水解酶（如ZETA_2），其晶体结构与设计模型高度吻合。该研究确立了“Zero-shot”酶设计新范式，无需后续定向进化即可直接获得高效催化剂，为开发新型生物催化剂开辟了新道路。