Nature｜植物转录激活结构域的鉴定

本文针对植物转录激活结构域（ADs）鉴定难题展开研究。背景方面，拟南芥中超过1900个转录因子仅有极少数ADs被注释，严重制约了对转录调控机制的理解。研究目的通过开发植物激活结构域鉴定（PADI）高通量分析系统，在蛋白质组规模系统筛选拟南芥转录因子ADs，并构建转录激活结构域活性（TADA）深度学习模型进行预测。结论显示成功鉴定出1553个ADs，发现53%的拟南芥转录因子至少含有一个AD，并首次识别出六种具有不同序列特征的AD亚型。通过生长素响应因子家族验证表明，不同AD亚型通过特征组合差异实现相似转录活性，且ADs在被子植物进化中具有功能保守性。