南京农业大学沈其荣院士团队在《Nature Communications》发文!利用AI突破三代宏基因组分箱的共性关键技术
生态学者
2025-10-27 13:21
文章摘要
背景:环境微生物组构成复杂且未知物种众多,高质量基因组挖掘困难,宏基因组测序技术虽有助于揭示微生物"暗物质",但面临数据量大、错误率高及算法不完善等挑战。研究目的:研发针对三代宏基因组的智能分箱算法LorBin,通过多尺度自适应聚类和评估技术,提升基因组重构的质量和数量,支持新物种挖掘和生物污染物识别。结论:LorBin算法在基准测试中性能卓越,重构高质量单菌基因组数量比现有工具多15–189%,识别特有物种数量达其他工具的2.4–17倍,并能高效识别致病菌和耐药基因,为微生物组分析提供高效解决方案。
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