曾泽贤与合作者评估亚细胞分辨率平台在人类肿瘤中表现Visium HD/Xenium/Stereo-seq/CosMx

本研究背景在于空间转录组学技术快速发展，但不同平台的性能差异缺乏系统评估。研究目的是通过比较四种前沿空间转录组平台（Stereo-seq v1.3、Visium HD FFPE、CosMx 6K和Xenium 5K）在人类肿瘤样本中的表现，为平台选择提供指导。研究结论表明：成像型平台更适合单细胞水平分析，测序型平台更适用于组织区域分析，而Stereo-seq v1.3在宿主-微生物互作研究中具有优势。该研究还开发了SPATCH平台用于数据共享和可视化，为空间转录组技术的应用和发展提供了重要参考。