bioRxiv｜斯坦福大学Hie团队：利用基因组语言模型生成新型噬菌体

背景：人工智能通过大规模基因组序列数据训练的语言模型能够学习复杂规律，实现具有预期功能的新型DNA序列生成式设计，但此前仅限于少量遗传元件。研究目的：利用基因组语言模型Evo 1和Evo 2生成具有真实遗传结构和理想宿主嗜性的全基因组序列，以裂解性噬菌体ΦX174为模板设计新型噬菌体。结论：成功生成16种可存活噬菌体，其中多株在生长竞争和裂解动力学方面优于ΦX174，组成的噬菌体混合物能快速克服三种大肠杆菌菌株的ΦX174抗性，证明了该方法在设计噬菌体疗法中的潜在应用价值。