arXiv｜融合结构预测与cryo-EM密度约束的模型CryoBoltz

背景：冷冻电镜（cryo-EM）技术在结构生物学中广泛应用，但现有结构预测工具如AlphaFold3和Boltz-1在解析某些构象时存在局限，自动结构搭建工具如ModelAngelo在中等分辨率下准确性不足。研究目的：开发CryoBoltz方法，融合AlphaFold3的序列驱动优势和cryo-EM实验数据，通过多尺度引导机制，在推理阶段引入密度图约束，以准确预测多样构象并生成与实验一致的原子模型。结论：CryoBoltz能有效处理构象多样性，在测试案例中成功预测了STP10蛋白的向内和向外开口构象，且在高分辨和真实cryo-EM密度下均优于对比方法，但存在数据准备方面的局限性，如使用理想化密度进行部分评估。