J Med Chem｜北京大学来鲁华等：基于强化学习的环肽binder从头设计
智药邦
2025-08-28 08:00
文章摘要
背景：环肽作为治疗性药物在靶向蛋白质相互作用方面具有潜力，但传统设计方法效率有限。研究目的：北京大学来鲁华团队开发了基于强化学习的计算框架CYC_BUILDER，用于靶向特异性环肽binder的从头设计。该框架通过蒙特卡洛树搜索算法指导片段组装和环化，整合结合能、稳定性和环化倾向性等多维度评估。结论：实验验证表明，针对TNFα设计的环肽表现出优异结合能力（KD达1.29μM）和细胞活性，能有效抑制NF-κB信号通路，为治疗性环肽开发提供了高效计算工具。
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