福建农林大学博士生一作在国际著名期刊(IF=19.4)上发表研究论文
溪远讲植物科学
2025-08-12 10:21
文章摘要
本文介绍了福建农林大学资源与环境学院环境基因组团队在《Nature Protocols》上发表的一篇方法类文章。该文章提出了一套基于R语言microeco包的微生物多组学数据统计分析和可视化流程,旨在应对微生物组领域实验设计复杂、数据量激增和组学数据类型多样化带来的挑战。文章涵盖了扩增子测序数据、宏基因组测序数据及非靶向代谢组数据的分析流程,包括数据预处理与标准化、核心物种识别、多样性分析、差异丰度检验及机器学习等关键步骤。作者们依据最佳实践选取标准化数据用于后续分析,并引入参数化群落模拟评估检验方法性能。与现有方法相比,该方案更为全面且具备良好的可扩展性。
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