PNAS | 上海交通大学鲁洪中等团队揭示了酵母适应不同的生态位驱动的基因组学和代谢重编程

本研究由上海交通大学鲁洪中和中国科学院大学周雍进团队共同完成，旨在揭示酿酒酵母适应不同生态位的基因组学和代谢重编程机制。研究整合了1,807株酿酒酵母的基因组资源，构建了高质量的泛基因组，并建立了菌株特异性基因组尺度代谢模型（ssGEMs）。通过整合代谢通量组学和转录组学数据，研究发现特定代谢途径在群体水平上普遍存在转录调控。此外，研究还发现来自不同生态位的菌株在基因组和代谢网络层面均发生了还原性进化。最终，研究揭示了源自不同低氧环境的酿酒酵母菌株间的显著代谢差异和趋同代谢进化现象，为理解酵母的适应性进化提供了重要线索。