来鲁华团队与合作者开发预测菌源胆汁酸代谢酶的新方法

本研究背景是胆汁酸作为肠道微生物调控宿主健康的关键代谢物，其合成途径尚不清楚，传统方法发现代谢酶效率低下。研究目的是开发一种基于AI的预测工具BEAUT，用于高效识别菌源胆汁酸代谢酶。研究团队通过“底物口袋相似性”数据增强策略，结合蛋白语言模型和神经网络，成功构建了BEAUT模型，并在实验验证中发现了新型胆汁酸代谢酶MABH和ADS，以及全新碳骨架胆汁酸3-乙酮脱氧胆酸。结论表明，BEAUT工具能有效预测低同源性的潜在胆汁酸代谢酶，为胆汁酸代谢研究提供了高效的新方法，并推动了AI在生命科学领域的应用。