JCIM｜Moltiverse：增强采样方法的分子构象生成

本文介绍了一种名为Moltiverse的新型构象生成方法，该方法结合了扩展自适应偏置力算法(eABF)和元动力学(metadynamics)，通过单一集体变量回转半径进行引导，以高效采样小分子的构象空间。研究背景指出，现有构象生成工具在准确性、多样性、结构合理性和计算效率之间存在平衡问题。Moltiverse在Platinum Diverse数据集和Prime大环数据集中表现出色，尤其在处理复杂大环分子时优于现有工具。尽管计算成本较高，但其生成的高质量构象集合在需要高精度或全面构象探索的应用中具有重要价值。文章还强调了多维度评估构象生成算法的重要性，包括准确性、精度、构象多样性等指标。