Adv Sci丨中国科学院冯桂海/周琪等团队研究发现FemXpress可通过X连锁SNP解析单细胞X染色体失活异质性

本文介绍了中国科学院冯桂海、周琪等团队开发的计算工具FemXpress，用于分析雌性单细胞RNA测序数据中的X染色体失活（XCI）异质性。FemXpress利用X连锁单核苷酸多态性（SNP）对细胞进行分组，无需亲本基因组信息，并能识别逃避XCI的基因。研究团队将该工具应用于食蟹猴多个组织的单细胞RNA测序数据，揭示了不同器官和细胞类型中XCI来源的异质性，并识别出候选的XCI逃逸基因。此外，FemXpress在胚胎和结肠肿瘤的scRNA-Seq数据集中表现出色。该研究为单细胞分辨率下的XCI动态研究提供了新的见解。