APS｜中国科学院上海药物研究所徐华强团队利用AlphaFold3预测的GPCR-小分子复合物评测

本研究由中国科学院上海药物研究所徐华强团队完成，主要评估了AlphaFold3在预测GPCR-小分子复合物结构中的表现。研究背景基于AlphaFold3作为最新蛋白质结构预测工具在药物开发中的应用潜力，研究目的是系统评估其在GPCR-小分子配体复合物预测中的精度和局限性。研究结果表明，AlphaFold3在整体受体骨架预测上表现优秀，但在小分子配体定位方面存在显著不稳定性，尤其是新型配体和别构调节剂的预测准确性较差。此外，AlphaFold3在预测GPCR激活态构象时表现不一，传统分子对接工具在某些情况下优于AlphaFold3。研究结论指出，AlphaFold3在药物设计中可作为补充工具，但仍需进一步改进和实验验证支持。