精度高，速度快！西湖大学团队开发端到端电子显微镜图像分析深度学习模型

本文介绍了西湖大学与新加坡国立大学的研究团队开发的端到端深度学习模型E3-CryoFold，用于高效准确地从冷冻电镜密度图解析蛋白质复合物的原子结构。该模型通过三维和序列Transformer提取特征，并利用交叉注意力模块整合两种模态信息，再通过SE(3)图神经网络构建原子结构。研究团队使用模拟密度图对模型进行预训练，显著提高了结构预测的准确性和效率，推理时间仅为现有方法的千分之一。尽管在形状调整、坐标约束和侧链建模方面仍存在挑战，E3-CryoFold在冷冻电镜图像分析领域取得了重要进展，为结构生物学研究提供了有力工具。