NSR | CGCompass：基于图结构与知识驱动的单细胞基础大模型

本文介绍了中国科学院多学科交叉研究团队“指南针联盟”开发的Cell-GraphCompass（CGCompass）模型，该模型基于图神经网络和5000万人类单细胞数据集训练，构建了新型人类单细胞基础模型。CGCompass通过图结构算法建模单个细胞，将基因视为节点，基因间关系作为边，深入挖掘基因间的复杂联系及其动态表达特征。该模型在细胞类型鉴定、基因扰动预测等多种生命科学任务中表现出色，为构建人类AI虚拟细胞迈出了重要一步。CGCompass在预训练、聚类、注释、zero-shot推理、基因扰动模拟等方面均表现出优异的性能，并展现出强大的泛化与迁移能力。未来，团队计划进一步整合多组学数据，打造更全面的多组学基础模型，助力前沿生命科学研究。