文章摘要
本研究由华中农业大学张献龙院士团队联合国内外多家科研机构完成,通过从头组装12个野生-驯化连续体的海岛棉基因组,构建了首个海岛棉高质量泛基因组,并解析了其纤维品质和产量相关性状的遗传变异及种间渐渗现象。海岛棉拥有世界顶级的纤维品质,但适应性差且产量低,导致市场长期供不应求。研究团队利用HiFi测序技术完成了12份海岛棉高质量基因组的从头组装,并通过泛基因组研究鉴定出129,673个海岛棉的非冗余结构变异和350,995个四倍体棉花的非冗余结构变异。研究发现,海岛棉在加勒比海地区与陆地棉发生了广泛的种间渐渗,但仅有少量渐渗保留到栽培种中。通过SV-GWAS分析,研究团队鉴定到多个纤维长度、纤维强度和衣分的遗传位点,并发现海岛棉的衣分和纤维品质间存在权衡关系。研究结果为海岛棉同步提升产量与纤维品质提供了新思路。
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