文献分享 |Nat. Commun.|snCED-seq:FFPE组织单核RNA测序的高保真低温酶解核分离方法

杨朝勇课题组 2025-05-26 12:45
文章摘要
本文介绍了一种名为snCED-seq的新技术,该技术结合了低温酶解核分离(CED)方法和snRandom-seq技术,用于从福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织中高效提取高质量细胞核并进行单核RNA测序。研究背景指出,FFPE组织是临床样本中最常见的保存形式,但传统方法在提取细胞核时面临RNA交联、修饰及降解等问题。研究目的是开发一种高保真度的细胞核提取方法,以提高FFPE样本的转录组研究质量。实验结果表明,snCED-seq方法显著提升了细胞核提取效率和RNA完整性,并在阿尔茨海默病(AD)小鼠模型和人肺FFPE样本中验证了其应用潜力。结论认为,snCED-seq为FFPE样本的转录组研究提供了可靠平台,具有广泛的临床应用前景。
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