Adv Sci丨南方医科大学王栋等研究介绍了一个用于推断scRNA-seq数据中TF活性的计算框架metaTF

本研究介绍了metaTF，一个用于推断单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中转录因子（TF）活性的计算框架。背景方面，scRNA-seq虽能研究细胞异质性，但基于基因表达谱的细胞身份识别方法可能无法反映功能差异。研究目的是通过metaTF整合多种数据源，构建静态先验网络，并结合动态调控网络，提高TF活性预测的准确性和稳定性。结论显示，metaTF在TF敲除和过表达数据中表现优于现有工具，并能有效识别细胞身份和功能特性，如在小鼠造血干细胞和乳腺癌上皮细胞中的应用。此外，metaTF还发现了一类新的神经调节T细胞亚群。