Hortic Res | 东北林业大学汪国华团队联合东北农业大学、哈尔滨工业大学发表首个高质量毛果杨单倍型基因组

本研究由东北林业大学汪国华团队联合东北农业大学、哈尔滨工业大学共同完成，首次实现了毛果杨（Populus trichocarpa）染色体级别、单倍型分辨率的基因组组装。研究背景源于毛果杨作为木本植物模式生物的重要科研和经济价值，但其杂合基因组的单倍型多样性此前未被完整解析。研究目的是构建高质量的毛果杨单倍型基因组，分析其遗传变异与功能特征。通过PacBio HiFi测序和Illumina Hi-C技术，成功组装了两个单倍型基因组（Ptr_A和Ptr_B），并进行了全面注释。研究发现两个单倍型之间存在大量遗传变异，并鉴定了组织特异性的等位基因表达模式。此外，通过比较基因组分析揭示了杨柳科植物的进化历史。结论表明，该研究为毛果杨及相关树种的遗传多样性、等位基因差异表达和基因功能研究提供了新的见解，为木本植物的遗传改良和基因编辑提供了理论基础和基因组资源。