吉林大学周丰丰团队提出多肽活性悬崖问题及抗菌肽活性预测任务评估框架

本文由吉林大学周丰丰团队发表在Journal of Advanced Research上，主要研究了抗菌肽（AMPs）中的活性悬崖现象，并提出了一个系统性分析框架AMPCliff。研究背景在于，尽管小分子药物中的活性悬崖现象已有较多研究，但抗菌肽中的类似现象尚未得到系统性解析。研究目的是定量定义抗菌肽中的活性悬崖，并评估现有深度学习方法在预测活性悬崖任务上的表现。通过对比多种相似度度量方式和数据划分策略，研究发现现有基于序列表征的深度学习方法在预测活性悬崖时存在显著偏差，特别是对局部氨基酸残基协同作用的捕捉能力不足。结论指出，未来研究应融入原子级动态相互作用信息以提升模型的机制解释性，为抗菌肽的理性设计提供方法论指引。