PNAS丨西安交通大学赵永席等团队合作发现PADSE-seq促进了各种邻近蛋白质的同时分析

该研究介绍了邻近激活DNA扫描编码测序（PADSE-seq）技术，用于在纳米尺度上分析膜蛋白的空间分布和邻近性。PADSE-seq利用长度可调的DNA探针，通过单链DNA的自主循环切割激活编码探针，实现蛋白质条形码与分子条形码的串联，并通过高通量测序分析多重蛋白质邻近性。研究验证了PADSE-seq在乳腺癌细胞系中映射HER2附近多种蛋白质分布的能力，发现低丰度目标蛋白周围的邻近蛋白展现出更大的空间分布多样性。该方法为细胞分子相互作用的高分辨率和全面映射提供了新途径，有助于深入了解复杂的生物学过程和推动精准医学的发展。