Nat Commun｜西湖大学王雅婕/原发杰：AI大语言模型开启新酶智能挖掘时代

本研究介绍了西湖大学王雅婕和原发杰团队开发的ESM-Ezy策略，该策略利用蛋白质大语言模型（如Meta ESM-1b）从海量蛋白质序列中挖掘新型优质酶。传统酶发现方法依赖序列相似性比对，当序列同源性低于30%时准确率显著下降。ESM-Ezy通过将酶序列转化为高维语义向量，捕捉功能关联性，即使序列差异显著也能发现功能相似的酶。研究团队成功挖掘出新型多铜氧化酶（MCOs）和天冬酰胺酶，这些酶在环境污染物处理和医药领域展现出巨大应用潜力。这一成果标志着酶资源开发从传统实验筛选迈入智能计算驱动的新时代，为合成生物学和环境修复等领域提供了新的技术支撑。