Sci Adv｜通过基于LLM的基础模型发现具有显著抗菌效力的抗菌肽

本文介绍了浙江大学侯廷军团队在SCIENCE ADVANCES上发表的基于大语言模型的抗菌肽设计方法AMP-Designer。面对全球细菌耐药性危机，特别是革兰氏阴性菌的耐药性问题，传统抗生素研发面临挑战，而抗菌肽(AMPs)因其结构多样性和较低的耐药性风险被视为潜在替代品。然而，AMPs存在活性、毒性和稳定性问题，且新AMPs发现效率低。为解决这些问题，作者提出了结合提示调整、对比学习、知识蒸馏和强化学习等先进技术的AMP-Designer框架。该方法在48天内成功设计出针对特定细菌的多种强效抗菌肽，其中KW13和AI18在实验中显示出强大抗菌能力且不易产生耐药性。该框架在数据有限情况下仍能有效工作，展示了其在抗菌肽设计上的灵活性和实用性。