【生物技术】Small Methods:空间转录组学数据全面分析和可视化的集成在线平台STExplore

MaterialsViews 2025-03-22 11:20
文章摘要
本文介绍了STExplore,一个专为空间转录组学设计的在线分析平台,旨在解决现有分析平台的局限性。空间转录组学是一种能够同时获取组织空间信息和基因表达信息的高通量分析方法,对于构建生物组织图谱、解析发育过程及研究疾病机制具有重要意义。STExplore平台能够处理来自所有主流技术的空间转录组数据,并提供全面的分析工作流程,包括预处理、整合scRNA-seq数据、聚簇层面分析、基因层面分析和细胞间通信。该平台还提供了交互式可视化功能,使用户能够直观地观察和验证假设,并根据分析结果动态调整参数设置。通过多个数据集的案例分析,展示了STExplore在空间转录组数据分析中的强大功能和实用性。
【生物技术】Small Methods:空间转录组学数据全面分析和可视化的集成在线平台STExplore
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