山西农业大学孔照胜团队基于T2T完整基因组揭示红芸豆全基因组进化特征

山西农业大学孔照胜团队在Journal of Genetics and Genomics上发表研究，成功组装了红芸豆品种“品金芸4”的端粒到端粒(T2T)完整基因组，揭示了其复杂区域的序列结构和全基因组的进化特征。该研究利用多种测序技术，完成了高质量的基因组组装，并通过比较基因组学和代谢组学分析，揭示了与种皮着色相关的关键代谢途径和差异代谢物。研究发现，PJY4基因组中存在两次全基因组复制事件，扩张的基因家族主要富集在苯丙烷代谢通路等，可能与种子营养物质的代谢及环境适应有关。该研究为普通菜豆的遗传改良与分子育种提供了重要参考。