微流控技术助力单细胞基因组和转录组联合测序的突破 | Nature Methods

本文介绍了一种名为DEFND-seq的新技术，该技术结合了核小体耗竭和微流控技术，实现了从单细胞核中同时分析RNA和DNA的高通量测序。研究背景强调了单细胞测序技术在解析基因表达和基因组变异中的重要性，以及现有技术的局限性。DEFND-seq通过使用锂二碘水杨酸处理细胞核，提高了基因组DNA的可及性，并通过微流控技术实现了RNA和DNA的同时标记和测序。研究展示了该技术在细胞系、新鲜和存档手术标本中的应用，揭示了基因表达与拷贝数和单核苷酸变异之间的联系。结论指出，DEFND-seq技术的出现为研究复杂组织中的细胞异质性、肿瘤进化以及药物耐药机制提供了新的工具，并有望推动单细胞多组学研究进入一个新的阶段。