arXiv｜香港理工大学李青/范文琦团队：LLM时代，计算蛋白质科学进展如何

本文综述了香港理工大学李青/范文琦团队在LLM技术支持下的计算蛋白质科学的最新进展。文章首先介绍了蛋白质建模的生物学基础和数据概况，随后回顾了三类蛋白质语言模型（pLMs），这些模型能够理解氨基酸序列、识别结构和功能信息，并连接多种生物医学语言。文章详细讨论了pLMs在结构预测、功能预测和蛋白质设计中的应用，特别是在抗体设计、酶设计和药物靶点发现中的潜力。最后，文章指出了该领域的未来研究方向，包括数据稀缺、蛋白质相互作用建模、可解释性、计算与实验研究的结合以及计算效率等问题。