Nat Commun | 毕文健/岳伟华/张培培团队开发出分析纵向数据表型的GWAS新算法

本文介绍了北京大学与北京大学第六医院的毕文健/岳伟华/张培培合作团队在Nature Communications期刊上发表的一项新研究，该研究开发了一种名为SPAGRM的新算法，用于分析纵向数据表型的全基因组关联研究（GWAS）。纵向数据表型能够表征健康状况的动态演变规律，而SPAGRM算法能够有效控制样本之间的亲缘相关性，提升分析准确性和运算速度。研究团队利用该算法分析了从UK Biobank电子健康记录数据中提取的79个纵向性状，发现了7,463个与表型均值显著相关的遗传位点，以及362个与表型动态变化方差密切相关的遗传位点。该算法的核心代码用C++进行优化，具备更好的运算效率与内存控制。