Nat Methods评论｜利用人工智能预测一般生物分子的相互作用

本文讨论了利用人工智能预测生物分子相互作用的进展与挑战。背景方面，基于AlphaFold和RoseTTAFold的成功，研究人员正致力于开发能预测更广泛生物分子相互作用的人工智能模型。研究目的是通过扩展神经网络架构，利用大规模蛋白质结构数据库，预测蛋白质结构及其与其他生物分子的结合构象。尽管RoseTTAFold All-Atom和AlphaFold3展示了预测一般分子相互作用的潜力，但在涉及结构数据稀缺的RNA和小分子相互作用方面仍存在挑战。结论指出，未来的研究应侧重于将物理和化学知识融入人工智能模型，整合不同来源的数据，并加强科学界的合作，以充分发挥人工智能在预测生物分子相互作用方面的潜力。