NAR | 高珊团队全面优化四膜虫大核基因组注释

本文介绍了中国海洋大学高珊教授课题组在嗜热四膜虫大核基因组注释方面的最新研究成果。研究团队通过整合大规模的转录组数据和表观遗传学数据，运用机器学习模型、人工核对和实验验证，深度优化了嗜热四膜虫大核基因组的注释。研究新增了2481个基因，修订了23936个基因模型，并首次注释了26047个基因的UTR，鉴定出5500个基因的8,339种可变剪切亚型。这些优化显著提升了四膜虫基因组注释的完整性和准确性，为其他真核生物的基因组注释提供了有益的借鉴。此外，研究团队还鉴定了5525个天然反义转录本（NATs），并发现约20%的蛋白编码基因存在反义转录，为揭示四膜虫的转录调控机制提供了新的视角。