用ChatGPT,发一篇Nature Biomedical Engineering!
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2024-12-12 10:07
文章摘要
斯坦福大学的James Zou等研究人员在Nature Biomedical Engineering上发表了一项研究,提出了一种利用ChatGPT从文献中生成基因嵌入的简单有效方法。该方法通过GPT-3.5从单个基因的文本描述中生成基因嵌入,并通过平均每个基因表达水平加权的基因嵌入来生成单细胞嵌入。研究人员还为每个细胞创建了一个句子嵌入,仅使用按表达水平排序的基因名称。在多个下游任务中,特别是基因属性和细胞类型分类的任务中,研究人员命名为GenePT的模型表现出了与使用数百万细胞基因表达谱预训练的模型相当或更好的性能。这项研究表明,利用文献的大语言模型嵌入为编码单细胞生物学知识提供了一条简单有效的途径。
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