全球首个超10G的近乎完整基因组!
溪远讲植物科学
2024-12-05 18:39
文章摘要
2024年12月,河北大学杜会龙教授团队在国际权威科学杂志Nature Plants上发表了题为《The near-complete genome assembly of hexaploid wild oat reveals its genome evolution and divergence with cultivated oats》的研究成果。该研究成功解析了栽培燕麦的祖先种不实野燕麦与栽培皮燕麦的两个接近完整的参考基因组,其中野燕麦的基因组组装规模达到了10.99 Gb,全基因组仅遗留14个未填补的间隙,这在国际动植物研究领域中是首个超过10 Gb且近乎完整的基因组。研究全面揭示了野生与栽培燕麦着丝粒序列的整体结构及其动态进化历程,并鉴定出众多与燕麦驯化紧密相关的重要基因组进化事件及关键基因。特别地,研究发现了染色体4A至4D间发生的约28 Mb的大规模片段复制事件,该片段携带着多个与关键农艺性状(特别是产量)相关的候选基因,并通过全球范围内117份野生和栽培燕麦材料的分析,证实了这一片段在燕麦早期驯化过程中的重要作用。此外,群体遗传学分析进一步挖掘出大量与燕麦驯化密切相关的候选基因,为燕麦功能基因组学研究和遗传改良奠定了坚实的基础。
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