RFdiffusion从头设计生成互作蛋白，验证成功率超78%

本文介绍了利用RFdiffusion模型从头设计高互作蛋白质的新方法，并命名为InterProDesign（IPD）。该方法结合了Foldseek、HDOCK和AlphaFold 3等工具，能够高效且精准地筛选出与诱饵蛋白相互作用的天然蛋白，实验验证成功率超过78%。文章详细描述了IPD的工作流程，包括RFdiffusion设计互作蛋白、Foldseek搜索天然蛋白、HDOCK结合能评价以及AlphaFold 3整体评价等步骤。通过多维度评估，IPD能够显著缩短筛选时间并减少实验工作量，为研究动植物生物机制提供了重要的结构生物学信息。