Nat Commun｜湖南大学史俊峰/曾湘祥教授团队：DeepAMP助力发现新型广谱低耐药性抗菌肽

湖南大学史俊峰、曾湘祥教授团队与美国Cleveland Clinic的程飞雄教授团队合作，在Nature Communication上发表了一项关于新型广谱低耐药性抗菌肽的研究。研究背景是耐药菌感染已成为全球公共卫生安全的重大问题，传统抗生素开发周期长、成本高且耐药性问题严重。研究目的在于开发一种高效的抗菌肽生成模型，以应对这一挑战。研究团队开发了基于深度学习的AMP生成模型deepAMP，通过预训练和微调策略，成功筛选出具有强效、广谱抗菌活性的新型AMP。该模型无需依赖多序列比对，直接从一维肽序列进行学习，提高了训练效率。实验结果表明，deepAMP设计的AMP候选分子对多种革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌及耐药菌具有显著抑制作用，且具有良好的生物相容性和低细胞毒性。研究结论指出，deepAMP为高效、低成本的抗菌肽开发提供了新的可能性，展示了抗菌肽在对抗耐药性细菌中的巨大潜力。