细胞老化的有机观点

B.A. Carnes , D.O. Staats , M.B. Vaughan , T.M. Witten
{"title":"细胞老化的有机观点","authors":"B.A. Carnes ,&nbsp;D.O. Staats ,&nbsp;M.B. Vaughan ,&nbsp;T.M. Witten","doi":"10.1016/j.mlong.2010.06.002","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"<div><p>This paper reviews the general biological phenomenon of aging as it applies to cells. Philosophical concepts of aging arising from radiation and evolutionary biology are used as a historical context for our understanding of how cells age. The development of multicellularity, and with it, an extracellular matrix is discussed in order to reveal that the biological consequences of aging extend beyond the borders of a cell. The argument is made that an integration of knowledge across levels of biological organization and a unification of theories on aging is needed in order to progress toward a greater understanding of organismal and cellular aging. It is further suggested that complexity theory and a systems level approach provides the means by which that integration can be achieved. The consequences of aging have been observed at virtually every level of biological organization, from molecules to populations. Although explanations of aging are dominated by a few theories (e.g., Kirkwood's (1977) disposable soma theory <span>[1]</span> and Harman's (1956) free radical hypothesis <span>[2]</span>), countless others have been proffered as well (see Rattan (2006) <span>[3]</span> and Weinert and Timiras (2003) <span>[4]</span> for reviews). This proliferation reflects not only the intricacies of aging but also the need for a theory that integrates information across multiple interacting levels of biological organization. Contrary to reductionist expectation, the number of theories increases rather than decreases at progressively lower levels of biological organization. Nowhere is this more evident than at the cellular level. Thus, it is fitting to devote a special issue to the challenges inherent in understanding the dynamics of cellular aging. There are, however, several obstacles that complicate a discussion of cellular aging. Foremost among them is the term “aging” (or “senescence”) itself. What does it mean? How do you distinguish aging from non-aging? When did it arise? Is it universal, or can some organisms escape it? Is it reversible? Is it a monolithic process or a mixture of processes? What is the fundamental unit of aging: a molecule, a cell, a tissue, an organ, the organism, or all of these? Does multicellularity affect the complexity of aging? Did aging evolve? In other words, does it have a genetic basis? Is there a difference between replicative senescence, organismal senescence, and phenotypic plasticity? These are some of the questions that we hope to address in this article.</p></div><div><p>Les auteurs de cet article proposent une analyse conceptuelle du rôle de la sénescence cellulaire dans le vieillissement de l’organisme et dans les maladies qui l’accompagnent. Ils confrontent certaines des nombreuses théories proposées pour « expliquer » le vieillissement avec les notions essentielles résultant du modèle cellulaire du vieillissement in vitro et de son exploitation expérimentale. Ils commencent par s’interroger sur le sens des concepts « vieillissement » et « sénescence » en essayant d’abord de les définir en suivant l’argumentation de Bernard Strehler qui en a donné une définition valide. Suit ensuite l’interrogation sur la nature même du processus du vieillissement en essayant d’en remonter aux origines. Est-il programmé ou stochastique ? Comme la plupart des auteurs, Carnes et ses collègues acceptent aussi d’attribuer la sénescence aux « négligences de la Nature », l’évolution ne s’étant intéressée qu’à la reproduction efficace en vue de la survie de l’espèce et nullement à sa déchéance. Est-il programmé ou pas programmé, est la question suivante. La réponse découle de l’analyse biologique et historique ci-dessus esquissée. Les gènes ont évolué pour maintenir santé et vigueur et nullement pour accélérer la décrépitude. Pour conclure, en fin de paragraphe, les auteurs s’interrogent : la longévité est-elle souhaitée par l’évolution, contrairement au vieillissement, résultat de sa négligence. Suivent ensuite des paragraphes sur le nombre et la complexité des mécanismes qui contribuent au vieillissement : un ou multiples ? Compliqués ou complexes ? Cette analyse relève de la science de la complexité biologique. Un long chapitre est ensuite consacré au rôle de la multicellularité et de la matrice extracellulaire dans le vieillissement. Les remaniements de cette matrice au cours du vieillissement et son rôle dans les modifications des interactions cellulaires jouent un rôle important dans la perte des fonctions physiologiques de l’organisme. Ces concepts ont été exploités pour la compréhension du vieillissement cutané, largement tributaire des modifications avec l’âge de sa matrice extracellulaire et de la perte progressive de la communication cellule-matrice cutanée. Les mécanismes individuels ci-dessus discutés sont ensuite intégrés au niveau tissulaire, puis au niveau des systèmes physiologiques. Les auteurs insistent sur la nature émergente des propriétés des systèmes vivants, conséquence de l’interaction de leurs composants qui font naître des propriétés nouvelles. Grâce à la représentation des systèmes vivants comme des réseaux de communication, les auteurs arrivent à expliciter la nature des interactions des composants individuels, cellules, matrice, etc. sous la forme de réseaux de gènes et de protéines. Cette représentation permet de conceptualiser la séquence d’interactions des nombreux composants individuels en leur assignant des sites précis à l’intérieur des réseaux. Certain de ces éléments jouent des rôles-pivot dans des processus aussi complexes que la régulation de la longévité de l’organisme, comme <em>Caenorhabdiis elegans</em>, représenté sur les figures. Dans leur conclusion, les auteurs proposent une synthèse originale de la Science expérimentale et de la biologie du vieillissement grâce à des réflexions remarquables à un niveau épistémologique.</p></div>","PeriodicalId":100903,"journal":{"name":"Médecine & Longévité","volume":"2 3","pages":"Pages 141-150"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2010-09-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.mlong.2010.06.002","citationCount":"6","resultStr":"{\"title\":\"An organismal view of cellular aging\",\"authors\":\"B.A. Carnes ,&nbsp;D.O. Staats ,&nbsp;M.B. Vaughan ,&nbsp;T.M. 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There are, however, several obstacles that complicate a discussion of cellular aging. Foremost among them is the term “aging” (or “senescence”) itself. What does it mean? How do you distinguish aging from non-aging? When did it arise? Is it universal, or can some organisms escape it? Is it reversible? Is it a monolithic process or a mixture of processes? What is the fundamental unit of aging: a molecule, a cell, a tissue, an organ, the organism, or all of these? Does multicellularity affect the complexity of aging? Did aging evolve? In other words, does it have a genetic basis? Is there a difference between replicative senescence, organismal senescence, and phenotypic plasticity? These are some of the questions that we hope to address in this article.</p></div><div><p>Les auteurs de cet article proposent une analyse conceptuelle du rôle de la sénescence cellulaire dans le vieillissement de l’organisme et dans les maladies qui l’accompagnent. Ils confrontent certaines des nombreuses théories proposées pour « expliquer » le vieillissement avec les notions essentielles résultant du modèle cellulaire du vieillissement in vitro et de son exploitation expérimentale. Ils commencent par s’interroger sur le sens des concepts « vieillissement » et « sénescence » en essayant d’abord de les définir en suivant l’argumentation de Bernard Strehler qui en a donné une définition valide. Suit ensuite l’interrogation sur la nature même du processus du vieillissement en essayant d’en remonter aux origines. Est-il programmé ou stochastique ? Comme la plupart des auteurs, Carnes et ses collègues acceptent aussi d’attribuer la sénescence aux « négligences de la Nature », l’évolution ne s’étant intéressée qu’à la reproduction efficace en vue de la survie de l’espèce et nullement à sa déchéance. Est-il programmé ou pas programmé, est la question suivante. La réponse découle de l’analyse biologique et historique ci-dessus esquissée. 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摘要

本文综述了衰老的一般生物学现象,因为它适用于细胞。从辐射和进化生物学中产生的衰老哲学概念被用作我们理解细胞如何衰老的历史背景。多细胞的发展,并与它,细胞外基质的讨论,以揭示老化的生物学后果超出了一个细胞的边界。为了更好地理解有机体和细胞的衰老,需要跨生物组织层次的知识整合和衰老理论的统一。进一步提出,复杂性理论和系统级方法提供了实现集成的手段。从分子到种群,几乎在生物组织的每一个层面都观察到衰老的后果。尽管对衰老的解释被一些理论所主导(例如,Kirkwood(1977)的一次性躯体理论[1]和Harman(1956)的自由基假说[2]),但也有无数其他理论被提出(参见Rattan(2006)[3]和Weinert and Timiras(2003)[4])。这种扩散不仅反映了衰老的复杂性,也反映了对一种理论的需求,这种理论可以整合生物组织中多个相互作用水平的信息。与还原论的预期相反,在生物组织的逐渐降低的层次上,理论的数量增加而不是减少。这一点在细胞层面上表现得最为明显。因此,它是合适的专门问题,以挑战固有的理解细胞老化的动态。然而,有几个障碍使细胞衰老的讨论复杂化。其中最重要的是“衰老”(或“衰老”)这个词本身。这是什么意思?你如何区分衰老和非衰老?什么时候出现的?它是普遍存在的,还是某些生物可以逃脱?可逆吗?它是一个单一的过程还是多个过程的混合?衰老的基本单位是什么:一个分子、一个细胞、一个组织、一个器官、一个有机体,还是所有这些?多细胞是否会影响衰老的复杂性?衰老是进化的吗?换句话说,它有遗传基础吗?复制性衰老、机体衰老和表型可塑性之间有区别吗?这些是我们希望在本文中解决的一些问题。作者们在文章中提出了一种分析概念的方法,该方法可用于分析<s:1> <s:1> <s:1>细胞组织与生物组织之间的关系,以及分析疾病与生物组织之间的关系。在某些情况下,有些人认为,在某些情况下,<s:1> <s:1> <s:1>物质交换器- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -我开始对"视障"和"变性"这两个概念的概念进行调查,并对"变性"和"变性"这两个概念进行分析,伯纳德·斯特雷勒的论证表明,变性的定义是有效的。西装套间“审问自然même”,“审问过程”,“审问过程”,“审问起源”。你的计划是随机的吗?主管人员、Carnes和他的同事们接受了下列情况:1 .“从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,从本质上说,就是从本质上说,从本质上说,就是从本质上说。”我来编程,我来编程,我来提问。从生物学角度分析,从历史角度分析,从遗传角度分析,从遗传角度分析。Les g<s:1> not samvoluvole pour maintenir santoise et vigueur et nullement pour accacimlsamuere la dsamcraude。最后,在最后一段中,“审问者”的意思是:“长时间的薪金薪金是指长时间的薪金薪金,长时间的薪金是指长时间的薪金,长时间的薪金是指长时间的薪金,长时间的薪金是指长时间的薪金。”一段又一段的简短套用,这段又一段复杂的套用,这段套用,又一段套用,又一段套用,又一段套用。你的复杂吗?让我们来分析一下相关的“科学”和“复杂”生物学。长章节est ensuite consacr<s:1> au rôle de la multicularit<s:1> et de la matrix extrulaire dans le vieillisement。Les reements de cette matrix au courses du vieillissement et son rôle Les modiements des interactions cellulaires jouent un rôle重要的dans la perte des functions physiologques de l 'organisme。这些概念包括:<s:1> <s:1> <s:1>材料材料-胞外材料-通信细胞-胞外材料-通信细胞-胞外材料-胞外材料-通信细胞-胞外材料-胞外材料-胞外材料-胞外材料-胞外材料-胞外材料-胞外材料-胞外材料-胞外材料-胞外材料-胞外材料。从个体的角度出发,从组织的角度出发,从生理系统的角度出发,从组织的角度出发,从系统的角度出发。 作者强调生命系统特性的突现性,这是其组成部分相互作用的结果,从而产生新的特性。通过将生命系统表示为通信网络,作者能够以基因和蛋白质网络的形式解释个体成分、细胞、基质等之间相互作用的性质。这种表示允许通过在网络中分配精确的位置来概念化许多独立组件之间的交互顺序。其中一些元素在调节生物体寿命等复杂过程中发挥着关键作用,如图中所示的秀丽隐杆线虫。在他们的结论中,作者提出了一个原始的综合实验科学和衰老生物学,通过在认识论水平上的显著反思。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
An organismal view of cellular aging

This paper reviews the general biological phenomenon of aging as it applies to cells. Philosophical concepts of aging arising from radiation and evolutionary biology are used as a historical context for our understanding of how cells age. The development of multicellularity, and with it, an extracellular matrix is discussed in order to reveal that the biological consequences of aging extend beyond the borders of a cell. The argument is made that an integration of knowledge across levels of biological organization and a unification of theories on aging is needed in order to progress toward a greater understanding of organismal and cellular aging. It is further suggested that complexity theory and a systems level approach provides the means by which that integration can be achieved. The consequences of aging have been observed at virtually every level of biological organization, from molecules to populations. Although explanations of aging are dominated by a few theories (e.g., Kirkwood's (1977) disposable soma theory [1] and Harman's (1956) free radical hypothesis [2]), countless others have been proffered as well (see Rattan (2006) [3] and Weinert and Timiras (2003) [4] for reviews). This proliferation reflects not only the intricacies of aging but also the need for a theory that integrates information across multiple interacting levels of biological organization. Contrary to reductionist expectation, the number of theories increases rather than decreases at progressively lower levels of biological organization. Nowhere is this more evident than at the cellular level. Thus, it is fitting to devote a special issue to the challenges inherent in understanding the dynamics of cellular aging. There are, however, several obstacles that complicate a discussion of cellular aging. Foremost among them is the term “aging” (or “senescence”) itself. What does it mean? How do you distinguish aging from non-aging? When did it arise? Is it universal, or can some organisms escape it? Is it reversible? Is it a monolithic process or a mixture of processes? What is the fundamental unit of aging: a molecule, a cell, a tissue, an organ, the organism, or all of these? Does multicellularity affect the complexity of aging? Did aging evolve? In other words, does it have a genetic basis? Is there a difference between replicative senescence, organismal senescence, and phenotypic plasticity? These are some of the questions that we hope to address in this article.

Les auteurs de cet article proposent une analyse conceptuelle du rôle de la sénescence cellulaire dans le vieillissement de l’organisme et dans les maladies qui l’accompagnent. Ils confrontent certaines des nombreuses théories proposées pour « expliquer » le vieillissement avec les notions essentielles résultant du modèle cellulaire du vieillissement in vitro et de son exploitation expérimentale. Ils commencent par s’interroger sur le sens des concepts « vieillissement » et « sénescence » en essayant d’abord de les définir en suivant l’argumentation de Bernard Strehler qui en a donné une définition valide. Suit ensuite l’interrogation sur la nature même du processus du vieillissement en essayant d’en remonter aux origines. Est-il programmé ou stochastique ? Comme la plupart des auteurs, Carnes et ses collègues acceptent aussi d’attribuer la sénescence aux « négligences de la Nature », l’évolution ne s’étant intéressée qu’à la reproduction efficace en vue de la survie de l’espèce et nullement à sa déchéance. Est-il programmé ou pas programmé, est la question suivante. La réponse découle de l’analyse biologique et historique ci-dessus esquissée. Les gènes ont évolué pour maintenir santé et vigueur et nullement pour accélérer la décrépitude. Pour conclure, en fin de paragraphe, les auteurs s’interrogent : la longévité est-elle souhaitée par l’évolution, contrairement au vieillissement, résultat de sa négligence. Suivent ensuite des paragraphes sur le nombre et la complexité des mécanismes qui contribuent au vieillissement : un ou multiples ? Compliqués ou complexes ? Cette analyse relève de la science de la complexité biologique. Un long chapitre est ensuite consacré au rôle de la multicellularité et de la matrice extracellulaire dans le vieillissement. Les remaniements de cette matrice au cours du vieillissement et son rôle dans les modifications des interactions cellulaires jouent un rôle important dans la perte des fonctions physiologiques de l’organisme. Ces concepts ont été exploités pour la compréhension du vieillissement cutané, largement tributaire des modifications avec l’âge de sa matrice extracellulaire et de la perte progressive de la communication cellule-matrice cutanée. Les mécanismes individuels ci-dessus discutés sont ensuite intégrés au niveau tissulaire, puis au niveau des systèmes physiologiques. Les auteurs insistent sur la nature émergente des propriétés des systèmes vivants, conséquence de l’interaction de leurs composants qui font naître des propriétés nouvelles. Grâce à la représentation des systèmes vivants comme des réseaux de communication, les auteurs arrivent à expliciter la nature des interactions des composants individuels, cellules, matrice, etc. sous la forme de réseaux de gènes et de protéines. Cette représentation permet de conceptualiser la séquence d’interactions des nombreux composants individuels en leur assignant des sites précis à l’intérieur des réseaux. Certain de ces éléments jouent des rôles-pivot dans des processus aussi complexes que la régulation de la longévité de l’organisme, comme Caenorhabdiis elegans, représenté sur les figures. Dans leur conclusion, les auteurs proposent une synthèse originale de la Science expérimentale et de la biologie du vieillissement grâce à des réflexions remarquables à un niveau épistémologique.

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