Nathanael F. Prasetio, B. Kepel, Widdhi Bodhi, Fatimawali, A. Manampiring, Fona Budiarso
{"title":"Molecular Docking terhadap Senyawa Isoeleutherin dan Isoeleutherol sebagai Penghambat Pertumbuhan SARS-CoV-2","authors":"Nathanael F. Prasetio, B. Kepel, Widdhi Bodhi, Fatimawali, A. Manampiring, Fona Budiarso","doi":"10.35790/ebm.v9i1.31809","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Abstract: Dayak onions are herbal plants used by Indonesians as an anti-inflammatory, anticancer, antimicrobial, antidiabetic, antihypertensive and antiviral. By consuming herbal plants, it can increase immunity which is the main key in preventing the virus, especially COVID-19. This study was aimed to determine the effect of dayak active compound anchoring on the growth of the corona virus. This study used molecular docking method. The results of visualization of molecular docking when compared to the binding affinity of remdesivir obtained a binding affinity of -7.3, while the binding affinity of isoeleutherin and isoeleutherol was -6.9, so the result was lower than remdesivir. isoeleutherin and isoeleutherol compounds have a lower binding affinity value than remdesivir, so isoeleutherin and isoeleutherol compounds have lower yields as inhibitors of COVID-19.Keywords: dayak onions, SARS-CoV-2, molecular docking Abstrak: Bawang Dayak merupakan tanaman herbal yang digunakan masyarakat Indonesia sebagai antiinflamasi, antikanker, antimikroba, antidiabetes, antihipertensi dan antivirus. Dengan mengkonsumsi tanaman herbal dapat meningkatkan kekebalan tubuh yang menjadi kunci utama dalam mencegah virus terlebih COVID-19. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh penambatan senyawa aktif bawang dayak terhadap pertumbuhan dari corona virus. Jenis penelitian ini menggunakan metode penelitian penambatan molekul (molecular docking). Hasil visualisasi molecular docking jika dibandingkan binding affinity dari remdesivir didapatkan binding affinity yaitu -7,3 sedangkan binding affinity dari isoeleutherin dan isoeleutherol adalah -6,9, maka diperoleh hasil yang lebih rendah dari remdesivir. senyawa isoeleutherine dan isoeleutherol memiliki nilai binding affinity yang lebih rendah dari remdesivir, maka senyawa isoeleutherin dan isoeleutherol memiliki hasil yang lebih rendah sebagai penghambat COVID-19.Kata Kunci: bawang dayak, SARS-CoV-2, molecular docking","PeriodicalId":17693,"journal":{"name":"Jurnal e-Biomedik","volume":"37 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2021-03-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"1","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Jurnal e-Biomedik","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.35790/ebm.v9i1.31809","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 1
摘要
摘要:大葱是印尼人常用的抗炎、抗癌、抗菌、降糖、降压和抗病毒的草本植物。通过食用草药植物,可以提高免疫力,这是预防病毒,尤其是COVID-19的关键。本研究旨在确定大阳活性化合物锚定对冠状病毒生长的影响。本研究采用分子对接方法。分子对接可视化结果与瑞德西韦的结合亲和力比较,得到的结合亲和力为-7.3,而异戊糖苷与异戊糖醇的结合亲和力为-6.9,结果低于瑞德西韦。异戊二烯醚苷和异戊二烯醇化合物的结合亲和力值低于瑞德西韦,因此异戊二烯醚苷和异戊二烯醇化合物作为新冠病毒抑制剂的产率较低。摘要:巴旺大葱merupakan tanaman草药阳digunakan masyarakat印度尼西亚sebagai抗炎、抗结核、抗结核、抗糖尿病、抗高血压和抗病毒。登安,孟康苏斯,塔纳曼,中草药,孟康苏斯,孟康苏斯,孟康苏斯,孟康苏斯,孟康苏斯,孟康苏斯,孟康苏斯,孟康苏斯,孟康苏斯Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh penambatan senyawa aktif bawang dayak terhadap pertumbuhan dari冠状病毒。Jenis penelitian ini menggunakan方法penelitian penambatan分子对接。Hasil visualisasi分子对接jika dibandingkan结合亲和物dari remdesivir didapatkan结合亲和物yitu -7,3 sedangkan结合亲和物dari异刺甲醚dan异刺甲醚adalah -6,9, maka diperoleh Hasil yang lebih rendah dari remdesivir。senyawa异柳醚和异柳醚的结合亲和力yang lebih rendah dari remdesivir, maka senyawa异柳醚和异柳醚memiliki hasil yang lebih rendah sebagai penghambat COVID-19。卡塔昆慈:巴旺达亚克,SARS-CoV-2,分子对接
Molecular Docking terhadap Senyawa Isoeleutherin dan Isoeleutherol sebagai Penghambat Pertumbuhan SARS-CoV-2
Abstract: Dayak onions are herbal plants used by Indonesians as an anti-inflammatory, anticancer, antimicrobial, antidiabetic, antihypertensive and antiviral. By consuming herbal plants, it can increase immunity which is the main key in preventing the virus, especially COVID-19. This study was aimed to determine the effect of dayak active compound anchoring on the growth of the corona virus. This study used molecular docking method. The results of visualization of molecular docking when compared to the binding affinity of remdesivir obtained a binding affinity of -7.3, while the binding affinity of isoeleutherin and isoeleutherol was -6.9, so the result was lower than remdesivir. isoeleutherin and isoeleutherol compounds have a lower binding affinity value than remdesivir, so isoeleutherin and isoeleutherol compounds have lower yields as inhibitors of COVID-19.Keywords: dayak onions, SARS-CoV-2, molecular docking Abstrak: Bawang Dayak merupakan tanaman herbal yang digunakan masyarakat Indonesia sebagai antiinflamasi, antikanker, antimikroba, antidiabetes, antihipertensi dan antivirus. Dengan mengkonsumsi tanaman herbal dapat meningkatkan kekebalan tubuh yang menjadi kunci utama dalam mencegah virus terlebih COVID-19. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh penambatan senyawa aktif bawang dayak terhadap pertumbuhan dari corona virus. Jenis penelitian ini menggunakan metode penelitian penambatan molekul (molecular docking). Hasil visualisasi molecular docking jika dibandingkan binding affinity dari remdesivir didapatkan binding affinity yaitu -7,3 sedangkan binding affinity dari isoeleutherin dan isoeleutherol adalah -6,9, maka diperoleh hasil yang lebih rendah dari remdesivir. senyawa isoeleutherine dan isoeleutherol memiliki nilai binding affinity yang lebih rendah dari remdesivir, maka senyawa isoeleutherin dan isoeleutherol memiliki hasil yang lebih rendah sebagai penghambat COVID-19.Kata Kunci: bawang dayak, SARS-CoV-2, molecular docking