硅研究:预测钴和汞对蛋白质对梅里特糖尿病事件的影响

Maria Yosephine Himawan, Eko Suhartono, Fujiati Fujiati, M. Mashuri, B. Setiawan
{"title":"硅研究:预测钴和汞对蛋白质对梅里特糖尿病事件的影响","authors":"Maria Yosephine Himawan, Eko Suhartono, Fujiati Fujiati, M. Mashuri, B. Setiawan","doi":"10.20527/ht.v6i1.8801","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Kalimantan Selatan merupakan provinsi yang memiliki sumber daya alam yang melimpah khususnya di sektor pertambangan. Logam berat hasil buangan tambang batubara yang tidak diolah bersifat sangat beracun bagi lingkungan dan manusia seperti merkuri dan kobalt yang berdampak pada kesehatan manusia seperti gangguan proses glikolisis. Penelitian in bertujuan untuk mengetahui interaksi logam berat merkuri dan kobalt terhadap enzim glukokinase, 11β-hydroxysteroid dehydrogenase-1, dipeptidyl peptidase-IV, dan Interleukin-1β dengan PDB ID: 1V4S, 2BEL, 1J2E, 9ILB yang diambil dari protein data bank serta menggukan website molecular docking MIB2: Metal Ion Binding Site Prediction and Docking server. Hasil docking divisualisasikan menggunakan aplikasi Chimera versi 1.16. Ditemukan hasil dari molecular docking logam berat merkuri dan kobalt dapat berinteraksi dengan keempat protein. Ion logam merkuri berikatan secara hidrofobik dengan residu asam amino interleukin 1 β dan ikatan kovalen koordinasi glukokinase, 11β-hydroxysteroid dehydrogenase-1, dan dipeptidyl peptidase-IV. Sedangkan ion logam kobalt berikatan secara kovalen koordinasi dengan residu asam amino enzim glukokinase, 11β-hydroxysteroid dehydrogenase-1, dipeptidyl peptidase-IV, dan Interleukin-1β. Dari keempat protein, ion logam merkuri berikatan paling kuat dengan enzim dipeptidyl peptidase-IV dikarenakan dipeptidyl peptidase-IV memiliki binding potensial yang lebih kuat tetapi pada jarak ikatan ion merkuri lebih mendekati ke enzim glukokinase tersebut.","PeriodicalId":77544,"journal":{"name":"Homeostasis in health and disease : international journal devoted to integrative brain functions and homeostatic systems","volume":"93 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-05-23","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"STUDI IN SILICO: PREDIKSI DAMPAK KOBALT DAN MERKURI TERHADAP PROTEIN PADA KEJADIAN DIABETES MELITUS\",\"authors\":\"Maria Yosephine Himawan, Eko Suhartono, Fujiati Fujiati, M. Mashuri, B. Setiawan\",\"doi\":\"10.20527/ht.v6i1.8801\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Kalimantan Selatan merupakan provinsi yang memiliki sumber daya alam yang melimpah khususnya di sektor pertambangan. Logam berat hasil buangan tambang batubara yang tidak diolah bersifat sangat beracun bagi lingkungan dan manusia seperti merkuri dan kobalt yang berdampak pada kesehatan manusia seperti gangguan proses glikolisis. Penelitian in bertujuan untuk mengetahui interaksi logam berat merkuri dan kobalt terhadap enzim glukokinase, 11β-hydroxysteroid dehydrogenase-1, dipeptidyl peptidase-IV, dan Interleukin-1β dengan PDB ID: 1V4S, 2BEL, 1J2E, 9ILB yang diambil dari protein data bank serta menggukan website molecular docking MIB2: Metal Ion Binding Site Prediction and Docking server. Hasil docking divisualisasikan menggunakan aplikasi Chimera versi 1.16. Ditemukan hasil dari molecular docking logam berat merkuri dan kobalt dapat berinteraksi dengan keempat protein. Ion logam merkuri berikatan secara hidrofobik dengan residu asam amino interleukin 1 β dan ikatan kovalen koordinasi glukokinase, 11β-hydroxysteroid dehydrogenase-1, dan dipeptidyl peptidase-IV. Sedangkan ion logam kobalt berikatan secara kovalen koordinasi dengan residu asam amino enzim glukokinase, 11β-hydroxysteroid dehydrogenase-1, dipeptidyl peptidase-IV, dan Interleukin-1β. Dari keempat protein, ion logam merkuri berikatan paling kuat dengan enzim dipeptidyl peptidase-IV dikarenakan dipeptidyl peptidase-IV memiliki binding potensial yang lebih kuat tetapi pada jarak ikatan ion merkuri lebih mendekati ke enzim glukokinase tersebut.\",\"PeriodicalId\":77544,\"journal\":{\"name\":\"Homeostasis in health and disease : international journal devoted to integrative brain functions and homeostatic systems\",\"volume\":\"93 1\",\"pages\":\"\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2023-05-23\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Homeostasis in health and disease : international journal devoted to integrative brain functions and homeostatic systems\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.20527/ht.v6i1.8801\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Homeostasis in health and disease : international journal devoted to integrative brain functions and homeostatic systems","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.20527/ht.v6i1.8801","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

摘要

南加里曼丹是一个拥有丰富自然资源的省,特别是在矿业部门。未经处理的重金属对环境和人类以及汞、钴等对人类健康的影响,如糖化过程的干扰。在研究旨在探讨互动对酶glukokinase重金属汞和钴,11β-hydroxysteroid dehydrogenase-1, dipeptidyl peptidase-IV, Interleukin-1β和ID: 1V4S gdp, 2BEL 1J2E 9ILB取自蛋白质数据银行和利益的分子对接MIB2:金属离子印象深刻Site Prediction网站服务器和对接。使用1.16嵌合体应用程序观察结果。从分子对接汞和钴的重金属中发现,可以与四种蛋白质相互作用。汞金属离子结合的疏水氨基酸残留物白细胞介素1β和共价键glukokinase协调,11β-hydroxysteroid dehydrogenase-1, dipeptidyl peptidase-IV。而金属钴离子结合共价协调地glukokinase酶氨基酸残留物,11β-hydroxysteroid dehydrogenase-1, dipeptidyl peptidase-IV, Interleukin-1β。在这四种蛋白质中,汞离子与两种酶结合的强度最大的一种。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
STUDI IN SILICO: PREDIKSI DAMPAK KOBALT DAN MERKURI TERHADAP PROTEIN PADA KEJADIAN DIABETES MELITUS
Kalimantan Selatan merupakan provinsi yang memiliki sumber daya alam yang melimpah khususnya di sektor pertambangan. Logam berat hasil buangan tambang batubara yang tidak diolah bersifat sangat beracun bagi lingkungan dan manusia seperti merkuri dan kobalt yang berdampak pada kesehatan manusia seperti gangguan proses glikolisis. Penelitian in bertujuan untuk mengetahui interaksi logam berat merkuri dan kobalt terhadap enzim glukokinase, 11β-hydroxysteroid dehydrogenase-1, dipeptidyl peptidase-IV, dan Interleukin-1β dengan PDB ID: 1V4S, 2BEL, 1J2E, 9ILB yang diambil dari protein data bank serta menggukan website molecular docking MIB2: Metal Ion Binding Site Prediction and Docking server. Hasil docking divisualisasikan menggunakan aplikasi Chimera versi 1.16. Ditemukan hasil dari molecular docking logam berat merkuri dan kobalt dapat berinteraksi dengan keempat protein. Ion logam merkuri berikatan secara hidrofobik dengan residu asam amino interleukin 1 β dan ikatan kovalen koordinasi glukokinase, 11β-hydroxysteroid dehydrogenase-1, dan dipeptidyl peptidase-IV. Sedangkan ion logam kobalt berikatan secara kovalen koordinasi dengan residu asam amino enzim glukokinase, 11β-hydroxysteroid dehydrogenase-1, dipeptidyl peptidase-IV, dan Interleukin-1β. Dari keempat protein, ion logam merkuri berikatan paling kuat dengan enzim dipeptidyl peptidase-IV dikarenakan dipeptidyl peptidase-IV memiliki binding potensial yang lebih kuat tetapi pada jarak ikatan ion merkuri lebih mendekati ke enzim glukokinase tersebut.
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信