橄榄植物酚类衍生物作为乳腺癌HER2抑制剂的硅基研究

L. Pangestu, W. Oktavelia, F. Ardiansyah, A. Khalilah, E. Novianti, S. Hidayat, T. N. Apriliya, Muchtaridi .
{"title":"橄榄植物酚类衍生物作为乳腺癌HER2抑制剂的硅基研究","authors":"L. Pangestu, W. Oktavelia, F. Ardiansyah, A. Khalilah, E. Novianti, S. Hidayat, T. N. Apriliya, Muchtaridi .","doi":"10.24843/jchem.2023.v17.i01.p08","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"ABSTRAK \n      Sebesar 11,7% dari 19,3 juta kasus kanker yang terjadi pada tahun 2020 merupakan kasus kanker payudara. Kanker ini umumnya disebabkan karena ekspresi berlebih dari protein HER-2 yang berperan dalam proliferasi dan pertumbuhan sel. Salah satu tipe kanker payudara, Triple Negative Breast Cancer (TNBC), menyumbang 10-20% dari semua kasus kanker payudara. Sebagai obat kanker payudara, lapatinib, telah digunakan untuk pasien kanker payudara positif-HER2. Namun, telah diketahui bahwa obat tersebut dapat meningkatkan metastasis sel TNBC. Maka, diperlukan pencarian senyawa baru yang dapat lebih efektif dan aman untuk pengobatan kanker payudara, seperti senyawa yang terkandung dalam extra virgin olive oil (EVOO) dari tanaman zaitun yang mampu menginhibisi aktivitas tirosin kinase dari protein HER-2. Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui interaksi molekuler dan profil farmakokinetik senyawa turunan fenolat dari kandungan EVOO. Metode yang digunakan dalam penelitian ini menggungakan metode Studi In silico dilakukan dengan simulasi penambatan molekuler, memprediksi profil farmakokinetik dan toksisitas senyawa, serta drug-likeness yang mengacu pada Lipinski’s Rule of Five. Senyawa 1-Acetoxypinoresinol merupakan senyawa terbaik berdasarkan hasil penambatan molekuler dan profil farmakokinetiknya dengan free binding energy sebesar -4,74 kcal/mol, konstanta inhibisi 335,19 µm, dan terdapat interaksi dengan residu asam amino Asn237. Adapun Nilai HIA dan caco-2 sebesar 93,96% dan 27,75%, nilai PPB dan BBB sebesar 77,58% dan 0,026%, serta tidak bersifat mutagenik dan karsinogenik. Hasil yang didapatkan menyatakan bahwa Senyawa 1-Acetoxypinoresinol memiliki potensi sebagai inhibitor HER2 yang paling baik diantara senyawa lainnya yang terdapat dalam kandungan EVOO. \nKata kunci:   Extra virgin olive oil, HER-2, in silico, Kanker Payudara \nABSTRACT \nAbout 11.7% of the 19.3 million cancer cases in 2020 were breast cancer. This cancer is generally caused by overexpression of the HER-2 protein that plays a role in cell proliferation and growth. One type of breast cancer, Triple Negative Breast Cancer (TNBC), accounts for 10-20% of all breast cancer cases. Lapatinib is one of a drug that has been used for HER2-positive breast cancer patients. However, it's known that the drug can promote TNBC cell metastasis. Thus, it is necessary to search for more effective and safer compounds, such as compounds contained in extra virgin olive oil (EVOO) from olive plants for breast cancer treatment that can inhibit the activity of tyrosine kinase from the HER-2 protein. The purpose was to determine molecular interactions and pharmacokinetic profiles of phenolic derivatives from EVOO. The method used in this study was In silico study method carried out by simulating molecular docking, predicting the pharmacokinetic and toxicity profiles of compounds, as well as drug-likeness that refers to Lipinski's Rule of Five. Compound 1-Acetoxypinoresinol is the best compound based on molecular docking results and its pharmacokinetic profile with a free binding energy of -4.74 kcal/mol, an inhibition constant of 335.19 µm, and interactions with the amino acid residue Asn237. The HIA and caco-2 values ??were 93.96% and 27.75%, PPB and BBB values ??were 77.58% and 0.026%, and not mutagenic and carcinogenic. The results obtained stated that Compound 1-Acetoxypinoresinol has the potential to be the best HER2 inhibitor among other compounds contained in EVOO content. \nKeywords: Breast Cancer, Extra virgin olive oil, Breast Cancer, HER-2, in silico","PeriodicalId":17780,"journal":{"name":"Jurnal Kimia","volume":"11 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-01-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"In Silico Study of Phenolic Derivatives Compounds from Olive Plants (Olea europaea L.) as HER2 Inhibitors in Breast Cancer\",\"authors\":\"L. Pangestu, W. Oktavelia, F. Ardiansyah, A. Khalilah, E. Novianti, S. Hidayat, T. N. Apriliya, Muchtaridi .\",\"doi\":\"10.24843/jchem.2023.v17.i01.p08\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"ABSTRAK \\n      Sebesar 11,7% dari 19,3 juta kasus kanker yang terjadi pada tahun 2020 merupakan kasus kanker payudara. Kanker ini umumnya disebabkan karena ekspresi berlebih dari protein HER-2 yang berperan dalam proliferasi dan pertumbuhan sel. Salah satu tipe kanker payudara, Triple Negative Breast Cancer (TNBC), menyumbang 10-20% dari semua kasus kanker payudara. Sebagai obat kanker payudara, lapatinib, telah digunakan untuk pasien kanker payudara positif-HER2. Namun, telah diketahui bahwa obat tersebut dapat meningkatkan metastasis sel TNBC. Maka, diperlukan pencarian senyawa baru yang dapat lebih efektif dan aman untuk pengobatan kanker payudara, seperti senyawa yang terkandung dalam extra virgin olive oil (EVOO) dari tanaman zaitun yang mampu menginhibisi aktivitas tirosin kinase dari protein HER-2. Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui interaksi molekuler dan profil farmakokinetik senyawa turunan fenolat dari kandungan EVOO. Metode yang digunakan dalam penelitian ini menggungakan metode Studi In silico dilakukan dengan simulasi penambatan molekuler, memprediksi profil farmakokinetik dan toksisitas senyawa, serta drug-likeness yang mengacu pada Lipinski’s Rule of Five. Senyawa 1-Acetoxypinoresinol merupakan senyawa terbaik berdasarkan hasil penambatan molekuler dan profil farmakokinetiknya dengan free binding energy sebesar -4,74 kcal/mol, konstanta inhibisi 335,19 µm, dan terdapat interaksi dengan residu asam amino Asn237. Adapun Nilai HIA dan caco-2 sebesar 93,96% dan 27,75%, nilai PPB dan BBB sebesar 77,58% dan 0,026%, serta tidak bersifat mutagenik dan karsinogenik. Hasil yang didapatkan menyatakan bahwa Senyawa 1-Acetoxypinoresinol memiliki potensi sebagai inhibitor HER2 yang paling baik diantara senyawa lainnya yang terdapat dalam kandungan EVOO. \\nKata kunci:   Extra virgin olive oil, HER-2, in silico, Kanker Payudara \\nABSTRACT \\nAbout 11.7% of the 19.3 million cancer cases in 2020 were breast cancer. This cancer is generally caused by overexpression of the HER-2 protein that plays a role in cell proliferation and growth. One type of breast cancer, Triple Negative Breast Cancer (TNBC), accounts for 10-20% of all breast cancer cases. Lapatinib is one of a drug that has been used for HER2-positive breast cancer patients. However, it's known that the drug can promote TNBC cell metastasis. Thus, it is necessary to search for more effective and safer compounds, such as compounds contained in extra virgin olive oil (EVOO) from olive plants for breast cancer treatment that can inhibit the activity of tyrosine kinase from the HER-2 protein. The purpose was to determine molecular interactions and pharmacokinetic profiles of phenolic derivatives from EVOO. The method used in this study was In silico study method carried out by simulating molecular docking, predicting the pharmacokinetic and toxicity profiles of compounds, as well as drug-likeness that refers to Lipinski's Rule of Five. Compound 1-Acetoxypinoresinol is the best compound based on molecular docking results and its pharmacokinetic profile with a free binding energy of -4.74 kcal/mol, an inhibition constant of 335.19 µm, and interactions with the amino acid residue Asn237. The HIA and caco-2 values ??were 93.96% and 27.75%, PPB and BBB values ??were 77.58% and 0.026%, and not mutagenic and carcinogenic. The results obtained stated that Compound 1-Acetoxypinoresinol has the potential to be the best HER2 inhibitor among other compounds contained in EVOO content. \\nKeywords: Breast Cancer, Extra virgin olive oil, Breast Cancer, HER-2, in silico\",\"PeriodicalId\":17780,\"journal\":{\"name\":\"Jurnal Kimia\",\"volume\":\"11 1\",\"pages\":\"\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2023-01-31\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Jurnal Kimia\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.24843/jchem.2023.v17.i01.p08\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Jurnal Kimia","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.24843/jchem.2023.v17.i01.p08","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

摘要

2020年发生的19.30万例癌症病例中,摘要为11.7%。这种癌症通常是由于在细胞增殖和生长过程中作用的her2蛋白质的过量表现。一种乳腺癌,三种阴性乳癌,占所有乳癌病例的10-20%。作为一种治疗乳腺癌的药物,lapatinib已经被用于阳性乳腺癌患者。然而,研究表明,这种药物可以增加TNBC细胞的转移。因此,我们需要寻找一种对乳腺癌治疗更有效和更安全的新化合物,比如橄榄树中含有的一种化合物,这种化合物能够从一种her2蛋白中抑制甲状腺激酶的活性。本研究的目的是确定EVOO中酚衍生物的分子相互作用和药理动力学概况。本研究采用的方法利用分子增强模型进行研究,预测药物动力学和化合物毒性的分析,以及利平斯基的五项规则的druglikeness。1-Acetoxypinoresinol化合物分子是最好的化合物根据确保自由和简介farmakokinetiknya印象深刻-4,74 kcal / mol的能量,常数的抑制335.19µm,有残留的氨基酸Asn237互动。至于HIA和cacos 2的值为93.96%和277.75%,PPB和BBB的值为77.58%,0.026%,没有诱变和致癌。其结果表明,1- acetoxypinsinol化合物具有潜力成为EVOO子宫内最有效的HER2抑制剂。关键词:多余的橄榄油,疱疹2,在硅中,乳腺癌约11.7%这是一种癌症,通常是由于它的2种蛋白质过度暴露在细胞扩散和生长的过程中。一种癌症,三种负乳房溃疡,所有乳房溃疡的10-20%的账户。Lapatinib是治疗癌症阳性患者的药物之一。大家都知道毒品会促进TNBC细胞的转移。因此,寻找更多有效和安全的化合物是必要的,因此,作为一种从橄榄植物中获得额外的橄榄油,用于获得一种可能从她的2种蛋白质中的tyrosine激酶的活性。目的是确定从EVOO衍生出的分子相互作用和药学特性。用于这项研究的方法包括硅胶学的分子拟像、制药学和药物活性成分的预习,以及针对利平斯基五项规定的药物利弊。化合物1-Acetoxypinoresinol是最好的化合物改编自它的分子对接results和pharmacokinetic with a free印象深刻剖析4 . 74 kcal / mol的能量,抑制的康斯坦335。19µm, interactions著作百科全书》和《氨基酸酸residue Asn237。你和你的股票价值??是96%和27.75%,PPB和BBB values ??我们有77.58%,026%,没有突变和致癌。被归类为1- acetotoxsinol的结果有潜力成为EVOO其他化合物内最优秀的女性抑制剂。致命巨蟹座,特级初脱毛橄榄油,硕士-2巨蟹座,硅
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
In Silico Study of Phenolic Derivatives Compounds from Olive Plants (Olea europaea L.) as HER2 Inhibitors in Breast Cancer
ABSTRAK       Sebesar 11,7% dari 19,3 juta kasus kanker yang terjadi pada tahun 2020 merupakan kasus kanker payudara. Kanker ini umumnya disebabkan karena ekspresi berlebih dari protein HER-2 yang berperan dalam proliferasi dan pertumbuhan sel. Salah satu tipe kanker payudara, Triple Negative Breast Cancer (TNBC), menyumbang 10-20% dari semua kasus kanker payudara. Sebagai obat kanker payudara, lapatinib, telah digunakan untuk pasien kanker payudara positif-HER2. Namun, telah diketahui bahwa obat tersebut dapat meningkatkan metastasis sel TNBC. Maka, diperlukan pencarian senyawa baru yang dapat lebih efektif dan aman untuk pengobatan kanker payudara, seperti senyawa yang terkandung dalam extra virgin olive oil (EVOO) dari tanaman zaitun yang mampu menginhibisi aktivitas tirosin kinase dari protein HER-2. Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui interaksi molekuler dan profil farmakokinetik senyawa turunan fenolat dari kandungan EVOO. Metode yang digunakan dalam penelitian ini menggungakan metode Studi In silico dilakukan dengan simulasi penambatan molekuler, memprediksi profil farmakokinetik dan toksisitas senyawa, serta drug-likeness yang mengacu pada Lipinski’s Rule of Five. Senyawa 1-Acetoxypinoresinol merupakan senyawa terbaik berdasarkan hasil penambatan molekuler dan profil farmakokinetiknya dengan free binding energy sebesar -4,74 kcal/mol, konstanta inhibisi 335,19 µm, dan terdapat interaksi dengan residu asam amino Asn237. Adapun Nilai HIA dan caco-2 sebesar 93,96% dan 27,75%, nilai PPB dan BBB sebesar 77,58% dan 0,026%, serta tidak bersifat mutagenik dan karsinogenik. Hasil yang didapatkan menyatakan bahwa Senyawa 1-Acetoxypinoresinol memiliki potensi sebagai inhibitor HER2 yang paling baik diantara senyawa lainnya yang terdapat dalam kandungan EVOO. Kata kunci:   Extra virgin olive oil, HER-2, in silico, Kanker Payudara ABSTRACT About 11.7% of the 19.3 million cancer cases in 2020 were breast cancer. This cancer is generally caused by overexpression of the HER-2 protein that plays a role in cell proliferation and growth. One type of breast cancer, Triple Negative Breast Cancer (TNBC), accounts for 10-20% of all breast cancer cases. Lapatinib is one of a drug that has been used for HER2-positive breast cancer patients. However, it's known that the drug can promote TNBC cell metastasis. Thus, it is necessary to search for more effective and safer compounds, such as compounds contained in extra virgin olive oil (EVOO) from olive plants for breast cancer treatment that can inhibit the activity of tyrosine kinase from the HER-2 protein. The purpose was to determine molecular interactions and pharmacokinetic profiles of phenolic derivatives from EVOO. The method used in this study was In silico study method carried out by simulating molecular docking, predicting the pharmacokinetic and toxicity profiles of compounds, as well as drug-likeness that refers to Lipinski's Rule of Five. Compound 1-Acetoxypinoresinol is the best compound based on molecular docking results and its pharmacokinetic profile with a free binding energy of -4.74 kcal/mol, an inhibition constant of 335.19 µm, and interactions with the amino acid residue Asn237. The HIA and caco-2 values ??were 93.96% and 27.75%, PPB and BBB values ??were 77.58% and 0.026%, and not mutagenic and carcinogenic. The results obtained stated that Compound 1-Acetoxypinoresinol has the potential to be the best HER2 inhibitor among other compounds contained in EVOO content. Keywords: Breast Cancer, Extra virgin olive oil, Breast Cancer, HER-2, in silico
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信