{"title":"实验室常规粪便中囊虫频率及亚型的调查","authors":"Yeliz Çetinkol, Savaş Aslan, Betül Fatmanur Yildirim, Hatice Ertabaklar, Erdoğan Malatyali","doi":"10.5578/mb.202502150","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"<p><p>İnsanlarda kolonda yerleşen zoonotik bir protist olan Blastocystis, son yıllarda özellikle patojenitesi ve genetik çeşitliliğiyle önemli bir araştırma konusu olmuştur. Farklı bölgelerde yapılan moleküler epidemiyoloji çalışmaları, Blastocystis'in toplumdaki dağılımını ve bunu etkileyen faktörlerin araştırılmasına olanak sağlamıştır. Bu çalışmada rutin laboratuvar dışkı örneklerinde Blastocystis görülme sıklığının, alt tip [subtype (ST)] dağılımının ve ilişkili klinik bulguların değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Araştırma kapsamında, Afyonkarahisar Sağlık Bilimleri Üniversitesi Tıp Fakültesi, Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvarına rutin parazitoloji incelemesi için gönderilen dışkı örnekleri değerlendirilmiştir. İki aylık sürede toplanan 252 dışkı örneğinde Blastocystis pozitifliği ilk başta direkt mikroskopi (DM) ile araştırılmıştır. Daha sonra örneklerden genomik DNA izolasyonu yapılarak polimeraz zincir reaksiyonu [polymerase chain reaction (PCR)] ile Blastocystis pozitifliği incelenmiştir. Blastocystis küçük alt-ünite ribozomal RNA (SSU rRNA) kısmi gen sekansları temel alınarak veri tabanları karşılaştırmaları yapılmış ve filogenetik analizlerle ST'ler belirlenmiştir. Ayrıca, olası miks ST'lerin varlığı ST-spesifik primerler kullanılarak araştırılmıştır. Dışkı örneği alınan bireylerde yaş, cinsiyet, yerleşim yeri, klinik bulgular ile enterik adenovirüs ve rotavirüs pozitifliği incelenmiştir. Çalışmada, 252 dışkı örneğinin 11 (%4.3)'inde DM yöntemiyle Blastocystis formları tespit edilmiş, yapılan PCR incelemesinde ise 16 örnekte (%6.3) Blastocystis pozitifliği saptanmıştır. Sekans analizleri sonucunda ST dağılımı ST3 (dokuz izolat, %56.2), ST2 (dört izolat, %25) ve ST1 (üç izolat, %18.8) olarak belirlenmiştir. Örneklerde miks ST'lerin varlığına rastlanmamıştır. Blastocystis pozitifliği açısından kadınlar (%5.8) ve erkekler (%6.8) arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunmamıştır (p> 0.05). Bununla birlikte, Blastocystis pozitif olguların yaş ortalaması, negatif olanlardan istatistiksel olarak anlamlı düzeyde yüksek tespit edilmiştir (p< 0.05). Çalışma kapsamındaki 172 kişide enterik adenovirüs ve rotavirüs pozitifliği immünokromatografik hızlı tanı testiyle değerlendirilmiştir. Tüm örneklerde adenovirüs negatif saptanırken, 19 (%11)'unda ise rotavirüs pozitif olarak bulunmuştur. Blastocystis pozitifliği ile klinik bulgular arasındaki ilişki değerlendirildiğinde anlamlı bir farklılık saptanmamıştır. Çalışmada ST dağılımı incelendiğinde diğer verilerle uyumlu olduğu görülmüştür. Görülen klinik bulgular değerlendirildiğinde ise Blastocystis'in asemptomatik kolonizasyonu fikri bu çalışma tarafından da desteklenmiştir. Blastocystis tanısında birden fazla yöntemin birlikte kullanılmasının pozitif örneklerin tespit edilmesi olasılığını artıracağı ve ayrıca Blastocystis ve viral etkenlerin birlikteliği konusunda, mikrobiyotayı da göz önüne alan daha kapsamlı çalışmalara ihtiyaç olduğu düşünülmektedir.</p>","PeriodicalId":18509,"journal":{"name":"Mikrobiyoloji bulteni","volume":"59 2","pages":"217-227"},"PeriodicalIF":1.1000,"publicationDate":"2025-04-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"[The Investigation of Blastocystis Frequency and Subtypes in Routine Laboratory Faecal Samples].\",\"authors\":\"Yeliz Çetinkol, Savaş Aslan, Betül Fatmanur Yildirim, Hatice Ertabaklar, Erdoğan Malatyali\",\"doi\":\"10.5578/mb.202502150\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"<p><p>İnsanlarda kolonda yerleşen zoonotik bir protist olan Blastocystis, son yıllarda özellikle patojenitesi ve genetik çeşitliliğiyle önemli bir araştırma konusu olmuştur. Farklı bölgelerde yapılan moleküler epidemiyoloji çalışmaları, Blastocystis'in toplumdaki dağılımını ve bunu etkileyen faktörlerin araştırılmasına olanak sağlamıştır. Bu çalışmada rutin laboratuvar dışkı örneklerinde Blastocystis görülme sıklığının, alt tip [subtype (ST)] dağılımının ve ilişkili klinik bulguların değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Araştırma kapsamında, Afyonkarahisar Sağlık Bilimleri Üniversitesi Tıp Fakültesi, Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvarına rutin parazitoloji incelemesi için gönderilen dışkı örnekleri değerlendirilmiştir. İki aylık sürede toplanan 252 dışkı örneğinde Blastocystis pozitifliği ilk başta direkt mikroskopi (DM) ile araştırılmıştır. Daha sonra örneklerden genomik DNA izolasyonu yapılarak polimeraz zincir reaksiyonu [polymerase chain reaction (PCR)] ile Blastocystis pozitifliği incelenmiştir. Blastocystis küçük alt-ünite ribozomal RNA (SSU rRNA) kısmi gen sekansları temel alınarak veri tabanları karşılaştırmaları yapılmış ve filogenetik analizlerle ST'ler belirlenmiştir. Ayrıca, olası miks ST'lerin varlığı ST-spesifik primerler kullanılarak araştırılmıştır. Dışkı örneği alınan bireylerde yaş, cinsiyet, yerleşim yeri, klinik bulgular ile enterik adenovirüs ve rotavirüs pozitifliği incelenmiştir. Çalışmada, 252 dışkı örneğinin 11 (%4.3)'inde DM yöntemiyle Blastocystis formları tespit edilmiş, yapılan PCR incelemesinde ise 16 örnekte (%6.3) Blastocystis pozitifliği saptanmıştır. Sekans analizleri sonucunda ST dağılımı ST3 (dokuz izolat, %56.2), ST2 (dört izolat, %25) ve ST1 (üç izolat, %18.8) olarak belirlenmiştir. Örneklerde miks ST'lerin varlığına rastlanmamıştır. Blastocystis pozitifliği açısından kadınlar (%5.8) ve erkekler (%6.8) arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunmamıştır (p> 0.05). Bununla birlikte, Blastocystis pozitif olguların yaş ortalaması, negatif olanlardan istatistiksel olarak anlamlı düzeyde yüksek tespit edilmiştir (p< 0.05). Çalışma kapsamındaki 172 kişide enterik adenovirüs ve rotavirüs pozitifliği immünokromatografik hızlı tanı testiyle değerlendirilmiştir. Tüm örneklerde adenovirüs negatif saptanırken, 19 (%11)'unda ise rotavirüs pozitif olarak bulunmuştur. Blastocystis pozitifliği ile klinik bulgular arasındaki ilişki değerlendirildiğinde anlamlı bir farklılık saptanmamıştır. Çalışmada ST dağılımı incelendiğinde diğer verilerle uyumlu olduğu görülmüştür. Görülen klinik bulgular değerlendirildiğinde ise Blastocystis'in asemptomatik kolonizasyonu fikri bu çalışma tarafından da desteklenmiştir. Blastocystis tanısında birden fazla yöntemin birlikte kullanılmasının pozitif örneklerin tespit edilmesi olasılığını artıracağı ve ayrıca Blastocystis ve viral etkenlerin birlikteliği konusunda, mikrobiyotayı da göz önüne alan daha kapsamlı çalışmalara ihtiyaç olduğu düşünülmektedir.</p>\",\"PeriodicalId\":18509,\"journal\":{\"name\":\"Mikrobiyoloji bulteni\",\"volume\":\"59 2\",\"pages\":\"217-227\"},\"PeriodicalIF\":1.1000,\"publicationDate\":\"2025-04-01\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Mikrobiyoloji bulteni\",\"FirstCategoryId\":\"3\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.5578/mb.202502150\",\"RegionNum\":4,\"RegionCategory\":\"医学\",\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"Q4\",\"JCRName\":\"MICROBIOLOGY\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Mikrobiyoloji bulteni","FirstCategoryId":"3","ListUrlMain":"https://doi.org/10.5578/mb.202502150","RegionNum":4,"RegionCategory":"医学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q4","JCRName":"MICROBIOLOGY","Score":null,"Total":0}
[The Investigation of Blastocystis Frequency and Subtypes in Routine Laboratory Faecal Samples].
İnsanlarda kolonda yerleşen zoonotik bir protist olan Blastocystis, son yıllarda özellikle patojenitesi ve genetik çeşitliliğiyle önemli bir araştırma konusu olmuştur. Farklı bölgelerde yapılan moleküler epidemiyoloji çalışmaları, Blastocystis'in toplumdaki dağılımını ve bunu etkileyen faktörlerin araştırılmasına olanak sağlamıştır. Bu çalışmada rutin laboratuvar dışkı örneklerinde Blastocystis görülme sıklığının, alt tip [subtype (ST)] dağılımının ve ilişkili klinik bulguların değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Araştırma kapsamında, Afyonkarahisar Sağlık Bilimleri Üniversitesi Tıp Fakültesi, Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvarına rutin parazitoloji incelemesi için gönderilen dışkı örnekleri değerlendirilmiştir. İki aylık sürede toplanan 252 dışkı örneğinde Blastocystis pozitifliği ilk başta direkt mikroskopi (DM) ile araştırılmıştır. Daha sonra örneklerden genomik DNA izolasyonu yapılarak polimeraz zincir reaksiyonu [polymerase chain reaction (PCR)] ile Blastocystis pozitifliği incelenmiştir. Blastocystis küçük alt-ünite ribozomal RNA (SSU rRNA) kısmi gen sekansları temel alınarak veri tabanları karşılaştırmaları yapılmış ve filogenetik analizlerle ST'ler belirlenmiştir. Ayrıca, olası miks ST'lerin varlığı ST-spesifik primerler kullanılarak araştırılmıştır. Dışkı örneği alınan bireylerde yaş, cinsiyet, yerleşim yeri, klinik bulgular ile enterik adenovirüs ve rotavirüs pozitifliği incelenmiştir. Çalışmada, 252 dışkı örneğinin 11 (%4.3)'inde DM yöntemiyle Blastocystis formları tespit edilmiş, yapılan PCR incelemesinde ise 16 örnekte (%6.3) Blastocystis pozitifliği saptanmıştır. Sekans analizleri sonucunda ST dağılımı ST3 (dokuz izolat, %56.2), ST2 (dört izolat, %25) ve ST1 (üç izolat, %18.8) olarak belirlenmiştir. Örneklerde miks ST'lerin varlığına rastlanmamıştır. Blastocystis pozitifliği açısından kadınlar (%5.8) ve erkekler (%6.8) arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunmamıştır (p> 0.05). Bununla birlikte, Blastocystis pozitif olguların yaş ortalaması, negatif olanlardan istatistiksel olarak anlamlı düzeyde yüksek tespit edilmiştir (p< 0.05). Çalışma kapsamındaki 172 kişide enterik adenovirüs ve rotavirüs pozitifliği immünokromatografik hızlı tanı testiyle değerlendirilmiştir. Tüm örneklerde adenovirüs negatif saptanırken, 19 (%11)'unda ise rotavirüs pozitif olarak bulunmuştur. Blastocystis pozitifliği ile klinik bulgular arasındaki ilişki değerlendirildiğinde anlamlı bir farklılık saptanmamıştır. Çalışmada ST dağılımı incelendiğinde diğer verilerle uyumlu olduğu görülmüştür. Görülen klinik bulgular değerlendirildiğinde ise Blastocystis'in asemptomatik kolonizasyonu fikri bu çalışma tarafından da desteklenmiştir. Blastocystis tanısında birden fazla yöntemin birlikte kullanılmasının pozitif örneklerin tespit edilmesi olasılığını artıracağı ve ayrıca Blastocystis ve viral etkenlerin birlikteliği konusunda, mikrobiyotayı da göz önüne alan daha kapsamlı çalışmalara ihtiyaç olduğu düşünülmektedir.
期刊介绍:
Bulletin of Microbiology is the scientific official publication of Ankara Microbiology Society. It is published quarterly in January, April, July and October. The aim of Bulletin of Microbiology is to publish high quality scientific research articles on the subjects of medical and clinical microbiology. In addition, review articles, short communications and reports, case reports, editorials, letters to editor and other training-oriented scientific materials are also accepted. Publishing language is Turkish with a comprehensive English abstract. The editorial policy of the journal is based on independent, unbiased, and double-blinded peer-review. Specialists of medical and/or clinical microbiology, infectious disease and public health, and clinicians and researchers who are training and interesting with those subjects, are the target groups of Bulletin of Microbiology.