从概念验证到临床验证:用于纵向随访的低级别弥漫性胶质瘤的自动化分割

IF 3 3区 医学 Q2 CLINICAL NEUROLOGY
Jeremy Deverdun , Guillaume Clain , Margaux Verdier , Mathilde Carriere , Justine Meriadec , Hugues Duffau , Nicolas Menjot de Champfleur , Amélie Darlix , Emmanuelle Le Bars
{"title":"从概念验证到临床验证:用于纵向随访的低级别弥漫性胶质瘤的自动化分割","authors":"Jeremy Deverdun ,&nbsp;Guillaume Clain ,&nbsp;Margaux Verdier ,&nbsp;Mathilde Carriere ,&nbsp;Justine Meriadec ,&nbsp;Hugues Duffau ,&nbsp;Nicolas Menjot de Champfleur ,&nbsp;Amélie Darlix ,&nbsp;Emmanuelle Le Bars","doi":"10.1016/j.neurad.2025.101246","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"<div><h3>Introduction</h3><div>Le suivi des gliomes diffus de bas grade (DLGG) reste complexe en raison de leur nature infiltrante et des remodelages cérébraux post-chirurgicaux, rendant l’évaluation IRM difficile. Les critères RANO [1], basés sur des mesures 2D, manquent de précision pour détecter les changements volumétriques subtils cruciaux pour le suivi de la progression tumorale. L’évaluation volumétrique, bien que plus précise [2], repose souvent sur des segmentations manuelles longues et peu adaptées à la pratique clinique courante. Notre étude précédente [3] a démontré la faisabilité d'un modèle nnU-Net pour la segmentation des DLGG, mais une validation clinique avec des ensembles de données plus hétérogènes est essentielle.</div></div><div><h3>Méthodes</h3><div>Nous avons analysé 1971 examens IRM de 207 patients DLGG, incluant des suivis longitudinaux (9.55 examensâ±8.52) avec des acquisitions 2D et 3D FLAIR. Les données ont été divisées en ensembles d'entrainement (n=1771) et de validation (n=200). Le modèle nnU-Net a été entraîné en validation croisée. Les segmentations automatiques ont été comparées aux segmentations manuelles réalisées par des neuroradiologues, en utilisant les coefficients de Dice (DSC), et de corrélation de concordance (CCC).</div></div><div><h3>Résultats</h3><div>Le modèle a obtenu un DSC médian de 0.93, avec 64 % des cas montrant une excellente concordance (DSC 0.9) et une concordance quasi parfaite pour le volume tumoral et le diamètre moyen (CCC&gt;0.99). 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摘要

由于弥漫性低级别胶质瘤(DLGG)的浸润性和术后脑重塑,其监测仍然复杂,这使得MRI评估具有挑战性。基于二维测量的RANO标准[1]在检测对监测肿瘤进展至关重要的细微体积变化方面不够精确。体积评估虽然更精确[2],但往往依赖于冗长的手工剖面,不适合当前的临床实践。我们之前的研究[3]已经证明了nnU-Net模型用于DLGG分割的可行性,但使用更异构的数据集进行临床验证是至关重要的。方法分析了1971年207例DLGG患者的MRI检查,包括纵向随访(9.55检查±8.52),采用2D和3D FLAIR采集。数据分为训练集(n=1771)和验证集(n=200)。nnU-Net模型已经进行了交叉验证。使用Dice系数(DSC)和匹配相关系数(CCC),将自动分割与神经放射学家进行的手动分割进行比较。结果该模型的中位DSC为0.93,64%的病例表现出良好的一致性(DSC 0.9),肿瘤体积和平均直径接近完美的一致性(CCC>0.99)。随着训练数据的增加,性能提高到1771次检查(图1)。本研究验证了nnU-Net在DLGG自动分割方面的鲁棒性。纳入了纵向随访数据和术后腔病例,使本研究比其他研究[4]更完整,后者只关注术前数据集。结论我们的研究提供了一个高度精确的分割工具,表明其临床整合在改善肿瘤监测方面的潜力。除了度量估计,它还允许对大队列的细分区域进行有针对性的搜索。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
De la preuve de concept à la validation clinique : segmentation automatisée des gliomes diffus de bas grade pour le suivi longitudinal

Introduction

Le suivi des gliomes diffus de bas grade (DLGG) reste complexe en raison de leur nature infiltrante et des remodelages cérébraux post-chirurgicaux, rendant l’évaluation IRM difficile. Les critères RANO [1], basés sur des mesures 2D, manquent de précision pour détecter les changements volumétriques subtils cruciaux pour le suivi de la progression tumorale. L’évaluation volumétrique, bien que plus précise [2], repose souvent sur des segmentations manuelles longues et peu adaptées à la pratique clinique courante. Notre étude précédente [3] a démontré la faisabilité d'un modèle nnU-Net pour la segmentation des DLGG, mais une validation clinique avec des ensembles de données plus hétérogènes est essentielle.

Méthodes

Nous avons analysé 1971 examens IRM de 207 patients DLGG, incluant des suivis longitudinaux (9.55 examensâ±8.52) avec des acquisitions 2D et 3D FLAIR. Les données ont été divisées en ensembles d'entrainement (n=1771) et de validation (n=200). Le modèle nnU-Net a été entraîné en validation croisée. Les segmentations automatiques ont été comparées aux segmentations manuelles réalisées par des neuroradiologues, en utilisant les coefficients de Dice (DSC), et de corrélation de concordance (CCC).

Résultats

Le modèle a obtenu un DSC médian de 0.93, avec 64 % des cas montrant une excellente concordance (DSC 0.9) et une concordance quasi parfaite pour le volume tumoral et le diamètre moyen (CCC>0.99). Les performances ont progressé avec l'augmentation des données d'entraînement jusqu’à un plateau à 1771 examens (Fig.1).

Discussion

Cette étude valide la robustesse du nnU-Net pour la segmentation automatique des DLGG. L'inclusion de données de suivi longitudinal et de cas post-chirurgicaux avec des cavités rend cette étude plus complète par rapport à d'autres études [4], qui se sont concentrées uniquement sur des ensembles de données préopératoires.

Conclusion

Notre étude a fourni un outil de segmentation d'une grande précision, suggérant son potentiel d'intégration clinique pour améliorer la surveillance des tumeurs. Au-delà de l'estimation des métriques, il permet une recherche ciblée dans les zones segmentées pour de grandes cohortes.
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来源期刊
Journal of Neuroradiology
Journal of Neuroradiology 医学-核医学
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142
审稿时长
6-12 weeks
期刊介绍: The Journal of Neuroradiology is a peer-reviewed journal, publishing worldwide clinical and basic research in the field of diagnostic and Interventional neuroradiology, translational and molecular neuroimaging, and artificial intelligence in neuroradiology. The Journal of Neuroradiology considers for publication articles, reviews, technical notes and letters to the editors (correspondence section), provided that the methodology and scientific content are of high quality, and that the results will have substantial clinical impact and/or physiological importance.
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GB/T 7714-2015
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