Exploration génomique de l’agressivité des tumeurs neuroendocrines hypophysaires (PitNETs)

L’agressivité des PitNETs est évaluée aujourd’hui sur des critères cliniques et histologiques, aboutissant à des classifications régulièrement mises à jour. La place de critères moléculaires reste à définir. Les analyses « multi-omiques » montrent l’importance du lignage comme déterminant principal des classifications non supervisées.

Objectif

Identifier des caractéristiques génomiques associées aux caractéristiques d’agressivité des PitNETs.

Méthodes

Deux critères d’agressivité ont été explorés : cinétique de progression rapide, progression après radiothérapie. Une cohorte de 19 PitNETs présentant ≥ 1 critère d’agressivité et 130 PitNETs sans critère d’agressivité ont été incluses. Ces dernières ont été analysées par transcriptome, puce SNP et séquençage NGS.

Résultats

La classification transcriptomique non supervisée révèle une répartition selon le lignage plutôt que l’agressivité. Dans les PitNETs corticotropes, le clustering individualise un sous-groupe de 21 PitNETs incluant 9/10 des PitNETs avec critères d’agressivité, associé à une hypersécrétion de cortisol, et un statut USP8 wt. Dans les PitNETs lactotropes, le clustering isole un sous-groupe de 4 PitNETs avec critères d’agressivité, associé à un Ki67 élevé (médiane 30 %, range 10–50 %).

Les PitNETs avec critères d’agressivité montrent une large fraction de génome altéré (médiane 59,6 %, range 12–100 %), des variants pathogènes des gènes ATRX (n = 3, 16 %), PTEN (n = 3, 16 %), TP53 (n = 5, 26 %), et présentent une signature transcriptomique proliférative.

Conclusion

Les PitNETs présentant des critères d’agressivité sont associées à des marqueurs génomiques spécifiques. La valeur pronostique de ces marqueurs reste à établir.