低分辨质谱筛选:数据是基础

IF 1.8 Q4 TOXICOLOGY
Pierre Lescuyer, Jonathan Sidibe, Abderrahim Karmime, David Tonoli
{"title":"低分辨质谱筛选:数据是基础","authors":"Pierre Lescuyer,&nbsp;Jonathan Sidibe,&nbsp;Abderrahim Karmime,&nbsp;David Tonoli","doi":"10.1016/j.toxac.2024.03.059","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"<div><h3>Objectifs</h3><p>La spectrométrie de masse à haute résolution prend de plus en plus d’importance pour le criblage toxicologique clinique. Un système d’analyse basé sur une trappe 3D basse résolution comme le Bruker Toxtyper™ a-t-il encore sa place dans ce contexte ? Le but est d’apporter des éléments de réponses en présentant des données de criblage toxicologique obtenues avec cette instrumentation sur divers échantillons cliniques et des contrôles de qualité commerciaux (CQ).</p></div><div><h3>Méthode</h3><p>Les échantillons cliniques sont issus de la routine clinique du laboratoire de toxicologie des Hôpitaux Universitaires de Genève. L’utilisation de ces échantillons de manière anonymisée pour l’évaluation de méthodes analytiques est approuvée par la commission d’éthique de la recherche du Canton de Genève. Les CQ ont été obtenus auprès de ACQ Science, LGC Standards et du Centre Suisse de Contrôle de Qualité (CSCQ). Les préparations d’échantillons sont basées sur une extraction en phase solide sur colonne Chromabond HLB (Macherey-Nagel) et une extraction liquide-liquide à pH alcalin. Les analyses ont été réalisées sur une trappe 3D Bruker Amazon Speed couplée à un système HPLC Thermo Scientific Ultimate 3000 équipé avec une colonne C18. Les bases de données suivantes ont été utilisées : Toxtyper Libraries 1.1 (851 composés et métabolites) et 3.0 (1135 composés et métabolites), Maurer/Wissenbach/Weber Library for Toxtyper (&gt;<!--> <!-->3500 composés et métabolites).</p></div><div><h3>Résultats</h3><p>L’analyse de CQ commerciaux indique que le système Toxtyper est capable de détecter, avec un faible taux de faux-positifs, une large gamme de médicaments et de drogues d’abus avec une sensibilité appropriée pour une utilisation en toxicologie clinique. Ainsi, le taux d’identification sur un échantillon ACQ Science Urine DCT<!--> <!-->+<!--> <!-->25 % contenant 60 composés varie entre 75 et 82 % (<em>n</em> <!-->=<!--> <!-->3). Sur les enquêtes 2023 LGC Drugs of Abuse in Urine et CSCQ TO, les taux d’identification sont respectivement de 92 et 100 %. Une précédente étude ayant comparé sur 104 échantillons cliniques et forensiques ce système d’analyse avec une méthode de spectrométrie de masse à haute résolution supporte ces résultats (Joye<!--> <!-->T et al. Analytica Chimica Acta 2019). L’analyse d’échantillons cliniques montre cependant la difficulté à identifier de manière formelle les composés de certaines familles (ex. cathinones). La comparaison des versions 1.1 et 3.0 de la librairie Toxtyper montre aussi que l’intégration de nouveaux composés n’a pas toujours été réalisée avec le niveau de qualité suffisant. Enfin, la librairie Maurer/Wissenbach/Weber permet, en théorie, d’étendre de manière significative le nombre de substances détectables mais, du fait de l’absence de données de temps de rétention pour un nombre important de molécules, au prix de nombreux faux-positifs.</p></div><div><h3>Conclusion</h3><p>Les données obtenues montrent qu’un système de spectrométrie de masse basse résolution peut répondre de manière tout à fait satisfaisante en termes de gamme de composés détectés, de sensibilité et de spécificité aux besoins d’un criblage toxicologique clinique de première ligne. La simplicité de l’interprétation des résultats et le nombre réduit de faux-positifs en fait un outil de choix pour ce type d’application. Les limitations en termes de nombres d’entrées des librairies disponibles et la difficulté à caractériser certains composés, notamment les NPS, pourraient cependant limiter les possibilités d’application dans des contextes cliniques spécifiques ou dans le domaine médico-légal. Nos résultats indiquent également que, probablement plus que le pouvoir de résolution du spectromètre de masse, c’est le soin apporté au développement de la base de données qui fait la qualité des résultats d’analyse toxicologique.</p><p>En conclusion, un système de criblage toxicologique basé sur la spectrométrie de masse basse résolution peut couvrir une large partie des besoins d’un laboratoire de toxicologique clinique s’il est associé à une base de données de qualité.</p></div>","PeriodicalId":23170,"journal":{"name":"Toxicologie Analytique et Clinique","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.8000,"publicationDate":"2024-05-16","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"Criblage par spectrométrie de masse à basse résolution : les données c’est la base\",\"authors\":\"Pierre Lescuyer,&nbsp;Jonathan Sidibe,&nbsp;Abderrahim Karmime,&nbsp;David Tonoli\",\"doi\":\"10.1016/j.toxac.2024.03.059\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"<div><h3>Objectifs</h3><p>La spectrométrie de masse à haute résolution prend de plus en plus d’importance pour le criblage toxicologique clinique. Un système d’analyse basé sur une trappe 3D basse résolution comme le Bruker Toxtyper™ a-t-il encore sa place dans ce contexte ? Le but est d’apporter des éléments de réponses en présentant des données de criblage toxicologique obtenues avec cette instrumentation sur divers échantillons cliniques et des contrôles de qualité commerciaux (CQ).</p></div><div><h3>Méthode</h3><p>Les échantillons cliniques sont issus de la routine clinique du laboratoire de toxicologie des Hôpitaux Universitaires de Genève. L’utilisation de ces échantillons de manière anonymisée pour l’évaluation de méthodes analytiques est approuvée par la commission d’éthique de la recherche du Canton de Genève. Les CQ ont été obtenus auprès de ACQ Science, LGC Standards et du Centre Suisse de Contrôle de Qualité (CSCQ). Les préparations d’échantillons sont basées sur une extraction en phase solide sur colonne Chromabond HLB (Macherey-Nagel) et une extraction liquide-liquide à pH alcalin. Les analyses ont été réalisées sur une trappe 3D Bruker Amazon Speed couplée à un système HPLC Thermo Scientific Ultimate 3000 équipé avec une colonne C18. Les bases de données suivantes ont été utilisées : Toxtyper Libraries 1.1 (851 composés et métabolites) et 3.0 (1135 composés et métabolites), Maurer/Wissenbach/Weber Library for Toxtyper (&gt;<!--> <!-->3500 composés et métabolites).</p></div><div><h3>Résultats</h3><p>L’analyse de CQ commerciaux indique que le système Toxtyper est capable de détecter, avec un faible taux de faux-positifs, une large gamme de médicaments et de drogues d’abus avec une sensibilité appropriée pour une utilisation en toxicologie clinique. Ainsi, le taux d’identification sur un échantillon ACQ Science Urine DCT<!--> <!-->+<!--> <!-->25 % contenant 60 composés varie entre 75 et 82 % (<em>n</em> <!-->=<!--> <!-->3). Sur les enquêtes 2023 LGC Drugs of Abuse in Urine et CSCQ TO, les taux d’identification sont respectivement de 92 et 100 %. Une précédente étude ayant comparé sur 104 échantillons cliniques et forensiques ce système d’analyse avec une méthode de spectrométrie de masse à haute résolution supporte ces résultats (Joye<!--> <!-->T et al. Analytica Chimica Acta 2019). L’analyse d’échantillons cliniques montre cependant la difficulté à identifier de manière formelle les composés de certaines familles (ex. cathinones). La comparaison des versions 1.1 et 3.0 de la librairie Toxtyper montre aussi que l’intégration de nouveaux composés n’a pas toujours été réalisée avec le niveau de qualité suffisant. Enfin, la librairie Maurer/Wissenbach/Weber permet, en théorie, d’étendre de manière significative le nombre de substances détectables mais, du fait de l’absence de données de temps de rétention pour un nombre important de molécules, au prix de nombreux faux-positifs.</p></div><div><h3>Conclusion</h3><p>Les données obtenues montrent qu’un système de spectrométrie de masse basse résolution peut répondre de manière tout à fait satisfaisante en termes de gamme de composés détectés, de sensibilité et de spécificité aux besoins d’un criblage toxicologique clinique de première ligne. La simplicité de l’interprétation des résultats et le nombre réduit de faux-positifs en fait un outil de choix pour ce type d’application. Les limitations en termes de nombres d’entrées des librairies disponibles et la difficulté à caractériser certains composés, notamment les NPS, pourraient cependant limiter les possibilités d’application dans des contextes cliniques spécifiques ou dans le domaine médico-légal. Nos résultats indiquent également que, probablement plus que le pouvoir de résolution du spectromètre de masse, c’est le soin apporté au développement de la base de données qui fait la qualité des résultats d’analyse toxicologique.</p><p>En conclusion, un système de criblage toxicologique basé sur la spectrométrie de masse basse résolution peut couvrir une large partie des besoins d’un laboratoire de toxicologique clinique s’il est associé à une base de données de qualité.</p></div>\",\"PeriodicalId\":23170,\"journal\":{\"name\":\"Toxicologie Analytique et Clinique\",\"volume\":null,\"pages\":null},\"PeriodicalIF\":1.8000,\"publicationDate\":\"2024-05-16\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Toxicologie Analytique et Clinique\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352007824000817\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"Q4\",\"JCRName\":\"TOXICOLOGY\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Toxicologie Analytique et Clinique","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352007824000817","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q4","JCRName":"TOXICOLOGY","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

摘要

目标高分辨率质谱在临床毒理学筛选中的作用日益重要。在这种情况下,像布鲁克 Toxtyper™ 这样基于低分辨率三维阱的分析系统是否仍有用武之地?本文旨在通过介绍使用该仪器对各种临床样本和商业质量控制(QC)所获得的毒理学筛选数据,为您提供一些答案。使用这些匿名样本对分析方法进行评估已获得日内瓦州研究伦理委员会的批准。质控品来自 ACQ Science、LGC Standards 和 Centre Suisse de Contrôle de Qualité (CSCQ)。样品制备采用 Chromabond HLB 柱(Macherey-Nagel)进行固相萃取,并在碱性 pH 下进行液液萃取。分析在布鲁克公司的 Amazon Speed 3D 捕集器和配备 C18 色谱柱的 Thermo Scientific Ultimate 3000 HPLC 系统上进行。使用的数据库包括:Toxtyper Libraries 1.1(851 种化合物和代谢物)和 3.0(1135 种化合物和代谢物)、Maurer/Wissenbach/Weber Toxtyper 库(3500 种化合物和代谢物)。例如,含有 60 种化合物的 ACQ Science 尿液 DCT + 25% 样品的鉴定率在 75% 到 82% 之间(n = 3)。在 2023 年 LGC 尿液中滥用药物和 CSCQ TO 调查中,鉴定率分别为 92% 和 100%。之前的一项研究将该分析系统与 104 份临床和法医样本的高分辨率质谱方法进行了比较,结果也支持上述结果(Joye T 等人,Analytica Chimica Acta 2019)。不过,对临床样本的分析表明,正式鉴定某些系列的化合物(如卡西酮类)存在困难。对 Toxtyper 库 1.1 版和 3.0 版的比较也表明,新化合物的整合并不总是以足够高的质量水平进行。最后,从理论上讲,Maurer/Wissenbach/Weber 库可以大大增加可检测物质的数量,但由于缺乏大量分子的保留时间数据,其代价是产生大量假阳性。该系统解释结果简单,误报率低,是此类应用的首选工具。不过,由于可用的库条目数量有限,以及某些化合物(尤其是 NPS)难以定性,可能会限制其在特定临床环境或法医领域的应用。总之,如果与高质量的数据库相结合,基于低分辨率质谱的毒理学筛选系统可以满足临床毒理学实验室的大部分需求。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Criblage par spectrométrie de masse à basse résolution : les données c’est la base

Objectifs

La spectrométrie de masse à haute résolution prend de plus en plus d’importance pour le criblage toxicologique clinique. Un système d’analyse basé sur une trappe 3D basse résolution comme le Bruker Toxtyper™ a-t-il encore sa place dans ce contexte ? Le but est d’apporter des éléments de réponses en présentant des données de criblage toxicologique obtenues avec cette instrumentation sur divers échantillons cliniques et des contrôles de qualité commerciaux (CQ).

Méthode

Les échantillons cliniques sont issus de la routine clinique du laboratoire de toxicologie des Hôpitaux Universitaires de Genève. L’utilisation de ces échantillons de manière anonymisée pour l’évaluation de méthodes analytiques est approuvée par la commission d’éthique de la recherche du Canton de Genève. Les CQ ont été obtenus auprès de ACQ Science, LGC Standards et du Centre Suisse de Contrôle de Qualité (CSCQ). Les préparations d’échantillons sont basées sur une extraction en phase solide sur colonne Chromabond HLB (Macherey-Nagel) et une extraction liquide-liquide à pH alcalin. Les analyses ont été réalisées sur une trappe 3D Bruker Amazon Speed couplée à un système HPLC Thermo Scientific Ultimate 3000 équipé avec une colonne C18. Les bases de données suivantes ont été utilisées : Toxtyper Libraries 1.1 (851 composés et métabolites) et 3.0 (1135 composés et métabolites), Maurer/Wissenbach/Weber Library for Toxtyper (> 3500 composés et métabolites).

Résultats

L’analyse de CQ commerciaux indique que le système Toxtyper est capable de détecter, avec un faible taux de faux-positifs, une large gamme de médicaments et de drogues d’abus avec une sensibilité appropriée pour une utilisation en toxicologie clinique. Ainsi, le taux d’identification sur un échantillon ACQ Science Urine DCT + 25 % contenant 60 composés varie entre 75 et 82 % (n = 3). Sur les enquêtes 2023 LGC Drugs of Abuse in Urine et CSCQ TO, les taux d’identification sont respectivement de 92 et 100 %. Une précédente étude ayant comparé sur 104 échantillons cliniques et forensiques ce système d’analyse avec une méthode de spectrométrie de masse à haute résolution supporte ces résultats (Joye T et al. Analytica Chimica Acta 2019). L’analyse d’échantillons cliniques montre cependant la difficulté à identifier de manière formelle les composés de certaines familles (ex. cathinones). La comparaison des versions 1.1 et 3.0 de la librairie Toxtyper montre aussi que l’intégration de nouveaux composés n’a pas toujours été réalisée avec le niveau de qualité suffisant. Enfin, la librairie Maurer/Wissenbach/Weber permet, en théorie, d’étendre de manière significative le nombre de substances détectables mais, du fait de l’absence de données de temps de rétention pour un nombre important de molécules, au prix de nombreux faux-positifs.

Conclusion

Les données obtenues montrent qu’un système de spectrométrie de masse basse résolution peut répondre de manière tout à fait satisfaisante en termes de gamme de composés détectés, de sensibilité et de spécificité aux besoins d’un criblage toxicologique clinique de première ligne. La simplicité de l’interprétation des résultats et le nombre réduit de faux-positifs en fait un outil de choix pour ce type d’application. Les limitations en termes de nombres d’entrées des librairies disponibles et la difficulté à caractériser certains composés, notamment les NPS, pourraient cependant limiter les possibilités d’application dans des contextes cliniques spécifiques ou dans le domaine médico-légal. Nos résultats indiquent également que, probablement plus que le pouvoir de résolution du spectromètre de masse, c’est le soin apporté au développement de la base de données qui fait la qualité des résultats d’analyse toxicologique.

En conclusion, un système de criblage toxicologique basé sur la spectrométrie de masse basse résolution peut couvrir une large partie des besoins d’un laboratoire de toxicologique clinique s’il est associé à une base de données de qualité.

求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
CiteScore
0.90
自引率
33.30%
发文量
393
审稿时长
47 days
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信