{"title":"比勒奇克省鸢尾种植区罂粟病毒感染的现状和分子特征","authors":"Merve Koç, Filiz RANDA ZELYÜT","doi":"10.19159/tutad.1342858","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Dünyada yapılan çalışmalarda iris (Iris spp.) bitkilerinde birçok viral etmenin yoğun enfeksiyonlara neden olduğunu göstermiştir. Bunlardan potyvirüs cinsi türlerinin yaygın olduğu ve bitkilere önemli ölçüde zarar verdiği kaydedilmiştir. Türkiye’de ise hemen hemen her yerde yetişen iris bitkisinde potyviruslerin neden olduğu enfeksiyonlara yönelik çalışmalar oldukça sınırlıdır. Bu çalışma kapsamında 2022 yılında 34 simptomatik ve 7 asimptomatik olmak üzere toplam 41 iris bitkisi Güney Marmara bölgesinde bulunan Bilecik ilinden toplanmıştır. Örnekler potyvirus cinsine özgün dejenere primeler kullanarak konvansiyonel moleküler (RT-PCR) yöntemlerle testlenmiştir. Şiddetli mozaik belirtiler gösteren 6 bitkide potyvirus enfeksiyonu tespit edilmiştir. Elde edilen 6 potyvirus fragmentinin nükleotit dizileme çalışmaları tamamlandıktan sonra enfeksiyonlar İris şiddetli mozaik virüsü (Iris severe mosaic virus, ISMV)’nün neden olduğu belirlenmiştir. Bu izolatlar kendi aralarında yüksek %94’ün üzerinde nükleotit benzerliği gösterirken global izolat ile %82-99 oranlarında benzerlik göstermiştir. Filogenetik analizler ise bu dejenere primerle elde edilen NIb gen bölgesine göre potyvirüs türlerinin kendi aralarında başarılı bir şekilde ayrıldığını göstermiştir.","PeriodicalId":515907,"journal":{"name":"Türkiye Tarımsal Araştırmalar Dergisi","volume":"33 13","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2024-03-08","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"Bilecik İli İris Yetiştirilen Alanlarda Potyvirus Enfeksiyonlarının Durumu ve Moleküler Karakterizasyonu\",\"authors\":\"Merve Koç, Filiz RANDA ZELYÜT\",\"doi\":\"10.19159/tutad.1342858\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Dünyada yapılan çalışmalarda iris (Iris spp.) bitkilerinde birçok viral etmenin yoğun enfeksiyonlara neden olduğunu göstermiştir. Bunlardan potyvirüs cinsi türlerinin yaygın olduğu ve bitkilere önemli ölçüde zarar verdiği kaydedilmiştir. Türkiye’de ise hemen hemen her yerde yetişen iris bitkisinde potyviruslerin neden olduğu enfeksiyonlara yönelik çalışmalar oldukça sınırlıdır. Bu çalışma kapsamında 2022 yılında 34 simptomatik ve 7 asimptomatik olmak üzere toplam 41 iris bitkisi Güney Marmara bölgesinde bulunan Bilecik ilinden toplanmıştır. Örnekler potyvirus cinsine özgün dejenere primeler kullanarak konvansiyonel moleküler (RT-PCR) yöntemlerle testlenmiştir. Şiddetli mozaik belirtiler gösteren 6 bitkide potyvirus enfeksiyonu tespit edilmiştir. Elde edilen 6 potyvirus fragmentinin nükleotit dizileme çalışmaları tamamlandıktan sonra enfeksiyonlar İris şiddetli mozaik virüsü (Iris severe mosaic virus, ISMV)’nün neden olduğu belirlenmiştir. Bu izolatlar kendi aralarında yüksek %94’ün üzerinde nükleotit benzerliği gösterirken global izolat ile %82-99 oranlarında benzerlik göstermiştir. Filogenetik analizler ise bu dejenere primerle elde edilen NIb gen bölgesine göre potyvirüs türlerinin kendi aralarında başarılı bir şekilde ayrıldığını göstermiştir.\",\"PeriodicalId\":515907,\"journal\":{\"name\":\"Türkiye Tarımsal Araştırmalar Dergisi\",\"volume\":\"33 13\",\"pages\":\"\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2024-03-08\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Türkiye Tarımsal Araştırmalar Dergisi\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.19159/tutad.1342858\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Türkiye Tarımsal Araştırmalar Dergisi","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.19159/tutad.1342858","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
Bilecik İli İris Yetiştirilen Alanlarda Potyvirus Enfeksiyonlarının Durumu ve Moleküler Karakterizasyonu
Dünyada yapılan çalışmalarda iris (Iris spp.) bitkilerinde birçok viral etmenin yoğun enfeksiyonlara neden olduğunu göstermiştir. Bunlardan potyvirüs cinsi türlerinin yaygın olduğu ve bitkilere önemli ölçüde zarar verdiği kaydedilmiştir. Türkiye’de ise hemen hemen her yerde yetişen iris bitkisinde potyviruslerin neden olduğu enfeksiyonlara yönelik çalışmalar oldukça sınırlıdır. Bu çalışma kapsamında 2022 yılında 34 simptomatik ve 7 asimptomatik olmak üzere toplam 41 iris bitkisi Güney Marmara bölgesinde bulunan Bilecik ilinden toplanmıştır. Örnekler potyvirus cinsine özgün dejenere primeler kullanarak konvansiyonel moleküler (RT-PCR) yöntemlerle testlenmiştir. Şiddetli mozaik belirtiler gösteren 6 bitkide potyvirus enfeksiyonu tespit edilmiştir. Elde edilen 6 potyvirus fragmentinin nükleotit dizileme çalışmaları tamamlandıktan sonra enfeksiyonlar İris şiddetli mozaik virüsü (Iris severe mosaic virus, ISMV)’nün neden olduğu belirlenmiştir. Bu izolatlar kendi aralarında yüksek %94’ün üzerinde nükleotit benzerliği gösterirken global izolat ile %82-99 oranlarında benzerlik göstermiştir. Filogenetik analizler ise bu dejenere primerle elde edilen NIb gen bölgesine göre potyvirüs türlerinin kendi aralarında başarılı bir şekilde ayrıldığını göstermiştir.
求助内容：
应助结果提醒方式：
京公网安备 11010802042870号
