蔷薇科植物基因组大小多样性对不同生态梯度和种子大小的潜在适应意义

IF 0.5 4区 环境科学与生态学 Q4 BIODIVERSITY CONSERVATION
I. Borokini, Shaun R. Broderick, Zhi Gao, Joshua M. Hallas, James A. Birchler, Mary M. Peacock
{"title":"蔷薇科植物基因组大小多样性对不同生态梯度和种子大小的潜在适应意义","authors":"I. Borokini, Shaun R. Broderick, Zhi Gao, Joshua M. Hallas, James A. Birchler, Mary M. Peacock","doi":"10.3398/064.083.0301","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Abstract. Variation in genome size across taxa has been explained using neutral and nonadaptive theories; however, genome size variation among taxonomic groups can also be shaped by natural selection if it correlates with functional traits. This study investigated the potential adaptive significance of genome size in Ivesia, a radiating genus distributed in the western North American desert ecosystems. We estimated the genome size of 34 taxa (including 31 Ivesia taxa, 2 Potentilla taxa, and 1 Horkelia taxon) using flow cytometric methods. For each taxon, leaf samples were collected from 6 individuals in 1 location each; intraspecific genome size variation was investigated using samples collected from 11 Ivesia webberi populations. The results showed an 8.1-fold variance in genome size, ranging from 0.73 pg/2C in I. baileyi var. beneolens to 5.91 pg/2C in I. lycopodioides var. megalopetala. Only 6 taxa, with a genome size >1.5 pg/2C, significantly differed from the remaining taxa. Genome size in Ivesia is relatively small, which is typical of plants living in stressful environments. Also, genome size was significantly correlated with seed size and actual evapotranspiration both within I. webberi and among Ivesia taxa, thus supporting the predictions of the nucleotype theory and suggesting an adaptive significance of genome size in the genus. Genome size in I. webberi is mostly statistically nonsignificant; however, populations near the center of the species' known range have significantly larger genomes, which decrease in size toward the marginal populations. This intraspecific genome size gradient from range center toward range margins could be attributed to patterns of gene flow and geographic isolation. Resumen. La variación en el tamaño del genoma entre los taxones se ha explicado utilizando teorías neutrales y no adaptativas. Sin embargo, la variación del tamaño del genoma entre grupos taxonómicos también puede estar determinada por selección natural si se correlaciona con rasgos funcionales. Este estudio investigó la posible importancia adaptativa del tamaño del genoma en Ivesia, un género radiante distribuido en los ecosistemas desérticos del oeste de Norteamérica. Estimamos el tamaño del genoma de 34 taxones, incluidos 31 taxones de Ivesia y dos taxones adicionales de Potentilla y un taxón de Horkelia, utilizando métodos de citometría de flujo. Para cada taxón, recolectamos muestras de hojas de seis individuos en una localización cada uno. Mientras, investigamos la variación del tamaño del genoma intraespecífico utilizando muestras recolectadas de 11 poblaciones de Ivesia webberi. Los resultados mostraron una variación de 8.1 veces en el tamaño del genoma, que va desde 0.73 pg/2C en I. baileyi var. beneolens hasta 5.91 pg/2C en I. lycopodioides var. megalopetala. Solo seis taxones, con un tamaño de genoma >1.5 pg/2C, fueron significativamente diferentes al resto de los taxones. El tamaño del genoma en Ivesia es relativamente pequeño, lo cual es típico de las plantas que viven en ambientes de estrés. Además, el tamaño del genoma se correlacionó significativamente con el tamaño de la semilla y la evapotranspiración real tanto dentro de I. webberi como entre los taxones de Ivesia, apoyando así las predicciones de la teoría del nucleotipo y sugiriendo una importancia adaptativa del tamaño del genoma en el género. Estadísticamente, el tamaño del genoma en I. webberi no es significativo, sin embargo, las poblaciones cercanas al centro del rango conocido de la especie tienen genomas significativamente más grandes, lo que se reduce hacia las poblaciones marginales. 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Sin embargo, la variación del tamaño del genoma entre grupos taxonómicos también puede estar determinada por selección natural si se correlaciona con rasgos funcionales. Este estudio investigó la posible importancia adaptativa del tamaño del genoma en Ivesia, un género radiante distribuido en los ecosistemas desérticos del oeste de Norteamérica. Estimamos el tamaño del genoma de 34 taxones, incluidos 31 taxones de Ivesia y dos taxones adicionales de Potentilla y un taxón de Horkelia, utilizando métodos de citometría de flujo. Para cada taxón, recolectamos muestras de hojas de seis individuos en una localización cada uno. Mientras, investigamos la variación del tamaño del genoma intraespecífico utilizando muestras recolectadas de 11 poblaciones de Ivesia webberi. Los resultados mostraron una variación de 8.1 veces en el tamaño del genoma, que va desde 0.73 pg/2C en I. baileyi var. beneolens hasta 5.91 pg/2C en I. lycopodioides var. megalopetala. 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摘要

摘要基因组大小在不同类群间的变异一直是用中性和非适应性理论来解释的;然而,如果基因组大小与功能特征相关,类群间的基因组大小变异也可能是由自然选择形成的。本研究调查了分布在北美西部沙漠生态系统中的辐射属 Ivesia 的基因组大小的潜在适应意义。我们采用流式细胞计方法估算了 34 个类群(包括 31 个 Ivesia 类群、2 个 Potentilla 类群和 1 个 Horkelia 类群)的基因组大小。每个分类群的叶片样本均采集自 1 个地点的 6 个个体;利用从 11 个 Ivesia webberi 种群采集的样本研究了种内基因组大小的变化。结果显示,基因组大小的差异为 8.1 倍,从 I. baileyi var.只有 6 个类群的基因组大小大于 1.5 pg/2C,与其余类群有显著差异。Ivesia的基因组大小相对较小,这是生活在压力环境中的植物的典型特征。此外,无论是在 I. webberi 还是在 Ivesia 类群中,基因组大小与种子大小和实际蒸散量都有明显的相关性,从而支持了核型理论的预测,并表明基因组大小在该属中具有适应意义。在 I. webberi 中,基因组大小在统计学上大多不显著;然而,靠近该物种已知分布区中心的种群的基因组明显较大,向边缘种群的基因组大小逐渐减小。从分布区中心到分布区边缘的这种种内基因组大小梯度可能是基因流动和地理隔离模式造成的。小结基因组大小在类群间的变异可以用中性和非适应性理论来解释。然而,如果与功能特征相关,分类群之间基因组大小的变化也可能是由自然选择决定的。本研究调查了分布在北美西部沙漠生态系统中的辐射属(Ivesia)的基因组大小可能具有的适应重要性。我们利用流式细胞仪方法估算了 34 个类群的基因组大小,包括 31 个 Ivesia 类群、另外两个 Potentilla 类群和一个 Horkelia 类群。对于每个类群,我们都在一个地点采集了六个个体的叶片样本。同时,我们利用从 11 个 Ivesia webberi 种群中采集的样本研究了种内基因组大小变异。结果显示,基因组大小的变化范围为 8.1 倍,从 I. baileyi var. beneolens 的 0.73 pg/2C 到 I. lycopodioides var.只有基因组大小大于 1.5 pg/2C 的六个类群与其他类群有显著差异。Ivesia的基因组大小相对较小,这对于生活在压力环境中的植物来说很典型。此外,基因组大小与 I. webberi 和 Ivesia 类群的种子大小和实际蒸散量都有明显的相关性,这支持了核型理论的预测,并表明基因组大小在该属植物中具有重要的适应性。从统计学角度看,I. webberi 的基因组大小并不显著,但是,靠近该物种已知分布区中心的种群的基因组明显较大,向边缘种群则逐渐减小。种内基因组大小向分布区边缘的梯度可能是由于基因流动和地理隔离的模式造成的。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Potentially Adaptive Significance of Genome Size Diversity across Ecological Gradients and Seed Size in Ivesia (Rosaceae)
Abstract. Variation in genome size across taxa has been explained using neutral and nonadaptive theories; however, genome size variation among taxonomic groups can also be shaped by natural selection if it correlates with functional traits. This study investigated the potential adaptive significance of genome size in Ivesia, a radiating genus distributed in the western North American desert ecosystems. We estimated the genome size of 34 taxa (including 31 Ivesia taxa, 2 Potentilla taxa, and 1 Horkelia taxon) using flow cytometric methods. For each taxon, leaf samples were collected from 6 individuals in 1 location each; intraspecific genome size variation was investigated using samples collected from 11 Ivesia webberi populations. The results showed an 8.1-fold variance in genome size, ranging from 0.73 pg/2C in I. baileyi var. beneolens to 5.91 pg/2C in I. lycopodioides var. megalopetala. Only 6 taxa, with a genome size >1.5 pg/2C, significantly differed from the remaining taxa. Genome size in Ivesia is relatively small, which is typical of plants living in stressful environments. Also, genome size was significantly correlated with seed size and actual evapotranspiration both within I. webberi and among Ivesia taxa, thus supporting the predictions of the nucleotype theory and suggesting an adaptive significance of genome size in the genus. Genome size in I. webberi is mostly statistically nonsignificant; however, populations near the center of the species' known range have significantly larger genomes, which decrease in size toward the marginal populations. This intraspecific genome size gradient from range center toward range margins could be attributed to patterns of gene flow and geographic isolation. Resumen. La variación en el tamaño del genoma entre los taxones se ha explicado utilizando teorías neutrales y no adaptativas. Sin embargo, la variación del tamaño del genoma entre grupos taxonómicos también puede estar determinada por selección natural si se correlaciona con rasgos funcionales. Este estudio investigó la posible importancia adaptativa del tamaño del genoma en Ivesia, un género radiante distribuido en los ecosistemas desérticos del oeste de Norteamérica. Estimamos el tamaño del genoma de 34 taxones, incluidos 31 taxones de Ivesia y dos taxones adicionales de Potentilla y un taxón de Horkelia, utilizando métodos de citometría de flujo. Para cada taxón, recolectamos muestras de hojas de seis individuos en una localización cada uno. Mientras, investigamos la variación del tamaño del genoma intraespecífico utilizando muestras recolectadas de 11 poblaciones de Ivesia webberi. Los resultados mostraron una variación de 8.1 veces en el tamaño del genoma, que va desde 0.73 pg/2C en I. baileyi var. beneolens hasta 5.91 pg/2C en I. lycopodioides var. megalopetala. Solo seis taxones, con un tamaño de genoma >1.5 pg/2C, fueron significativamente diferentes al resto de los taxones. El tamaño del genoma en Ivesia es relativamente pequeño, lo cual es típico de las plantas que viven en ambientes de estrés. Además, el tamaño del genoma se correlacionó significativamente con el tamaño de la semilla y la evapotranspiración real tanto dentro de I. webberi como entre los taxones de Ivesia, apoyando así las predicciones de la teoría del nucleotipo y sugiriendo una importancia adaptativa del tamaño del genoma en el género. Estadísticamente, el tamaño del genoma en I. webberi no es significativo, sin embargo, las poblaciones cercanas al centro del rango conocido de la especie tienen genomas significativamente más grandes, lo que se reduce hacia las poblaciones marginales. Este gradiente de tamaño del genoma intraespecífico hacia la marginalidad del rango podría atribuirse a patrones de flujo de genes y aislamiento geográfico.
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来源期刊
Western North American Naturalist
Western North American Naturalist 环境科学-生态学
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期刊介绍: The Western North American Naturalist places neither restriction nor preference on manuscripts within the disciplines of the biological sciences. Each issue treats diverse taxa from the perspectives of various disciplines (e.g., ecology, population dynamics, behavior, systematics, anatomy, and physiology).
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GB/T 7714-2015
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