ПОЛНОГЕНОМНЫЙ ПОИСК АССОЦИАЦИЙ ОДНОНУКЛЕОТИДНЫХ ЗАМЕН С ЖИРНОКИСЛОТНЫМ СОСТАВОМ МОЛОКА КАРАЧАЕВСКИХ КОЗ

В статье приводятся результаты исследований по поиску генов-кандидатов, связанных с уровнем жира и жирнокислотным составом молока коз карачаевской породы на основе полногеномного анализа ассоциаций. Генотипирование выполняли с использованием ДНК-чипа GoatSNP53K Beadchip и программы BeadStudio, компонентный состав молока исследовали ИК-спектроскопией на автоматическом анализаторе CombiFoss 7 DC, ассоциативный анализ проводили множественной линейной регрессией с помощью программного пакета PLINK 1.90. Идентифицированы 26 полногеномных и 101 суггестивный SNP, связанные с содержанием жира и жирных кислот в молоке карачаевских коз, при этом наибольшее их число — 10, 8 и 14 SNP — выявлено на хромосомах 8, 16 и 25 соответственно. Полиморфизм snp16908-scaffold1766-616140 на хромосоме 25 является общим для 7 признаков (массовая доля жира, длинно-, средне- и короткоцепочечные, пальмитиновая, олеиновая жирные кислоты, трансизомеры жирных кислот), 3 полиморфизма — snp18646-scaffold1882-539299, snp10469-scaffold1373-2167084 и snp33285-scaffold391-913110 на хромосомах 2, 3 и 8 соответственно — для 5 признаков (насыщенные, средне- и короткоцепочечные, миристиновая и пальмитиновая жирные кислоты), полиморфизм snp3754-scaffold112-3973504 на хромосоме 16 — для 2 признаков (олеиновая и длинноцепочечные жирные кислоты). Структурная аннотация геномных регионов, покрывающих окно ±0,20 Mb от идентифицированных SNP, выявила 22 гена-кандидата, для 11 из которых описаны биологические функции в терминах генной онтологии. Установлено, что гены METTL8, INSIG1, CEMIP2, BAAT, PLPPR1, LACTB, FMO1, FMO2, ECI1, PGP и ABCA3 регулируют процессы липидного обмена и развития жировой ткани, и их следует рассматривать в качестве потенциальных ДНК-маркеров в селекции коз карачаевской породы.