植物王国中葡萄膜进化的硅分析

Ludmila Marques dos Santos Veloso, A. E. A. D. Barbosa
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Material e Métodos: Foi realizado uma busca em bancos de dados sequências de heveínas padrão, seguido do download dos genes que as codificam. As sequências foram submetidas ao algoritmo TBLASTN na base de dados “1K Plants” contra as linhagens de algas verdes, briófitas e pteridófitas, presença do domínio conservado foi verificado utilizando as ferramentas BLAST e INTERPROSCAN, seguido do alinhamento global dessas sequências utilizando a ferramenta Clustal W. Após a confirmação da presença dos AMPs, foi realizado a construção da árvore filogenética dessas sequências. Resultados: Os resultados sugerem que as heveínas encontradas hoje nas plantas superiores surgiram no grupo de plantas das pteridófitas após vários eventos de mutação, como clivagem e translocação, desde os grupos das algas verdes e briófitas e que resultaram no peptídeo heveínas. Conclusão: Portanto, podemos concluir que as heveínas completas com os domínios conservados surgiram nas pteridófitas.","PeriodicalId":138762,"journal":{"name":"Anais do I Congresso Brasileiro de Biotecnologia Vegetal On-line","volume":"748 ","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2021-11-22","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"ANÁLISE IN SILICO DA EVOLUÇÃO DAS HEVEÍNAS NO REINO PLANTAE\",\"authors\":\"Ludmila Marques dos Santos Veloso, A. E. A. D. Barbosa\",\"doi\":\"10.51189/rema/2420\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Introdução: A cadeia evolutiva das plantas sugere que as algas verdes são as precursoras diretas das plantas terrestres, seguidas pelas briófitas e pteridófitas. 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摘要

简介:植物的进化链表明,绿藻是陆生植物的直接前体,其次是苔藓植物和蕨类植物。植物是具有不同特性的生物活性物质的来源,在这些来源中,我们发现了AMPs(抗菌肽),这是植物对抗病原体的防御分子。他们包含了几个家庭,尤其是家人的heveínas,富含半胱氨酸,代表有能力连接到quitinas nematoides中存在,在真菌细胞壁和昆虫的外骨骼,使这组电流源生物技术的巨大潜力。摘要目的:利用生物信息学工具验证植物王族植物中葡萄膜的存在。材料和方法:对标准葡萄膜序列数据库进行搜索,然后下载编码它们的基因。序列算法TBLASTN遭到“1 k植物数据库”的迁移绿藻类,苔藓植物和蕨类植物,存在异常的确认使用工具的爆炸,INTERPROSCAN,全局比对的序列使用工具Clustal w后确认存在的安培数,实现了这些序列的系统发育树的构建。结果:结果表明,目前在高等植物中发现的葡萄膜蛋白是在绿藻和苔藓植物中经过裂解和易位等多次突变事件后出现在蕨类植物中,并产生了肽葡萄膜蛋白。结论:因此,我们可以得出结论,在蕨类植物中出现了具有保守结构域的完整链。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
ANÁLISE IN SILICO DA EVOLUÇÃO DAS HEVEÍNAS NO REINO PLANTAE
Introdução: A cadeia evolutiva das plantas sugere que as algas verdes são as precursoras diretas das plantas terrestres, seguidas pelas briófitas e pteridófitas. As plantas representam uma fonte de substâncias biologicamente ativas com propriedades diversas e entre essas fontes encontramos os AMPs (Peptídeos antimicrobianos), que são moléculas de defesa das plantas contra patógenos. Eles contêm várias famílias e em particular a família das heveínas, ricas em cisteínas, glicinas e que têm a capacidade de se ligar a quitinas, que estão presentes em nematoides, na parede celular de fungos e no exoesqueleto de insetos, tornando esse grupo de AMPs uma fonte biotecnológica de grande potencial. Objetivo: Este projeto verificou a presença de heveínas em espécies do reino Plantae utilizando ferramentas de bioinformática. Material e Métodos: Foi realizado uma busca em bancos de dados sequências de heveínas padrão, seguido do download dos genes que as codificam. As sequências foram submetidas ao algoritmo TBLASTN na base de dados “1K Plants” contra as linhagens de algas verdes, briófitas e pteridófitas, presença do domínio conservado foi verificado utilizando as ferramentas BLAST e INTERPROSCAN, seguido do alinhamento global dessas sequências utilizando a ferramenta Clustal W. Após a confirmação da presença dos AMPs, foi realizado a construção da árvore filogenética dessas sequências. Resultados: Os resultados sugerem que as heveínas encontradas hoje nas plantas superiores surgiram no grupo de plantas das pteridófitas após vários eventos de mutação, como clivagem e translocação, desde os grupos das algas verdes e briófitas e que resultaram no peptídeo heveínas. Conclusão: Portanto, podemos concluir que as heveínas completas com os domínios conservados surgiram nas pteridófitas.
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